[发明专利]一种鉴定广西涠洲岛豹纹鳃棘鲈原生种的SSR分子标记引物组及其应用

说明书

本发明提供一种鉴定广西涠洲岛豹纹鳃棘鲈原生种的SSR分子标记引物组及其应用。本发明通过研究得到一组能鉴定广西涠洲岛豹纹鳃棘鲈原生种的SSR分子标记：PLWZ‑01、PLWZ‑02、PLWZ‑03、PLWZ‑04、PLWZ‑05、PLWZ‑06，其核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1～6所示，该SSR分子标记具有多态性高，但在广西涠洲岛原生群体中多态性低的特点；通过筛选得到用于扩增SSR分子标记的引物组，其扩增稳定、重复性好；同时建立了鉴定广西涠洲岛豹纹鳃棘鲈原生种的方法，解决现有豹纹鳃棘鲈地理种群鉴别不清晰，在增殖放流种种苗的原生种亲本难于判别的问题。

技术领域

本发明属于分子生物技术领域。更具体地，涉及一种鉴定广西涠洲岛豹纹鳃棘鲈原生种的SSR分子标记引物组及其应用。

背景技术

豹纹鳃棘鲈(Plectropomus Leopardus)，俗名“东星斑”，隶属鲈形目(Perciformes)、鲈亚目(Perciformes)、鮨科(Serranidae)、石斑鱼亚科(Epinephelinae)、鳃棘鲈属(Plectropomus)，属暖水性岛礁海水鱼，主要分布于西太平洋至印度洋海域，是我国重要南方重要的养殖鱼类。豹纹鳃棘鲈肉质鲜嫩、味道鲜美，具有低脂肪、低胆固醇和高蛋白等特点，属高档食用鱼类，深受广大消费者喜爱，市场前景广阔。

涠洲岛位于广西壮族自治区北海市北部湾海域中部，北临广西北海市，东望雷州半岛，东南与斜阳岛毗邻，南与海南岛隔海相望，西面面向越南。涠洲岛地处热带珊瑚分布的北缘，地域特异性使其具有极高的生态价值。涠洲岛珊瑚礁海域的鱼类以鲈形目为主，鲈形目鱼类占采集物种总数的74.56％。其中豹纹鳃棘鲈是涠洲岛其中一种特色鱼类。但随着广西北部湾经济区建设的推进，以及旅游资源和海洋资源开发等人类活动的加剧，导致该海域豹纹鳃棘鲈资源急剧下降。

通过将人工增殖培育的豹纹鳃棘鲈幼苗投放到涠洲岛海域，是一种对天然种群恢复或增加的有效方法。然而，来自不同海域的豹纹鳃棘鲈在色泽、口味、品相各方面都会有差别，将来自其他海区亲本所培育的豹纹鳃棘鲈投放到涠洲岛海域，会对该海域种质资源造成污染。豹纹鳃棘鲈亲本非常难于获得，无法通过野外捕获的方法获得足够的亲本作为增殖放流育苗培育。同时，通过肉眼非常难判断豹纹鳃棘鲈亲本的原生地。目前有研究豹纹鳃棘鲈种群遗传结构和遗传变异采用微卫星分子标记方法，如现有技术公开了一种豹纹鳃棘鲈微卫星DNA分子标记的构建方法，通过设计微卫星标记的特异性引物，开发豹纹鳃棘鲈多态性丰富的微卫星标记，并应用于豹纹鳃棘鲈的种群遗传结构和遗传育种等研究中。但是，该方法只提供和验证了7对引物，而在豹纹鳃棘鲈中能检测到的14649个位点，如果用于不同的种群遗传结构分析验证，则要设计成千上万个特异性引物，操作复杂且费时费力，同时该方法设计得到的微卫星标记引物并不能鉴定和区分豹纹鳃棘鲈原生种。因此，需要建立一种可靠的分子生物学技术，用于鉴定广西涠洲岛的豹纹鳃棘鲈原生种。

发明内容

本发明的目的是提供一种鉴定广西涠洲岛豹纹鳃棘鲈原生种的SSR分子标记引物组及其应用，解决现有豹纹鳃棘鲈地理种群鉴别不清晰，在增殖放流种种苗的原生种亲本难于判别的问题。

本发明的第一个目的是提供一种鉴定广西涠洲岛豹纹鳃棘鲈原生种的SSR 分子标记。

本发明的第二个目的是提供一种扩增所述SSR分子标记的引物组。

本发明的第三个目的是提供所述SSR分子标记或所述引物组的应用。

本发明的第四个目的是提供一种鉴定广西涠洲岛豹纹鳃棘鲈原生的检测试剂盒。

本发明第五个目的是提供一种鉴定广西涠洲岛豹纹鳃棘鲈原生种的方法。

本发明第六个目的是提供所述鉴定广西涠洲岛豹纹鳃棘鲈原生种方法的应用。

本发明上述目的通过以下技术方案实现：