[发明专利]棉花抗黄萎病主效QTL位点紧密连锁的KASP引物和应用在审
申请号: | 202210425374.2 | 申请日: | 2022-04-22 |
公开(公告)号: | CN114891912A | 公开(公告)日: | 2022-08-12 |
发明(设计)人: | 赵云雷;王红梅;王桂峰;陈伟;魏学文;邢晓飞;芦建华;赵佩;桑晓慧;张杰;秦都林 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院棉花研究所;山东省农业技术推广中心(山东省农业农村发展研究中心) |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04 |
代理公司: | 北京天奇智新知识产权代理有限公司 11340 | 代理人: | 于益 |
地址: | 455000 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 棉花 黄萎病 qtl 紧密 连锁 kasp 引物 应用 | ||
1.一种棉花抗黄萎病主效QTL位点紧密连锁的KASP引物,其特征在于:所述KASP引物序列如SEQ ID NO:265-282所示;
其中,KASP-Z407标记的等位基因特异引物如SEQ ID NO:265-266所示,公共引物如SEQID NO:267所示;
KASP-Z367标记的等位基因特异引物如SEQ ID NO:268-269所示,公共引物如SEQ IDNO:270所示;
KASP-Z324标记的等位基因特异引物如SEQ ID NO:271-272所示,公共引物如SEQ IDNO:273所示;
KASP-Z427标记的等位基因特异引物如SEQ ID NO:274-275所示,公共引物如SEQ IDNO:276所示;
KASP-Z005标记的等位基因特异引物如SEQ ID NO:277-278所示,公共引物如SEQ IDNO:279所示;
KASP-Z428标记的等位基因特异引物如SEQ ID NO:280-281所示,公共引物如SEQ IDNO:282所示。
2.根据权利要求1所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点紧密连锁的KASP引物,其特征在于:抗黄萎病主效QTL位点分别为qVW-D05-1、qVW-D05-2、qVW-D05-3和qVW-A01-1;
其中,qVW-D05-1的连锁群为LG_D05.1,位置为53.7998cM,2LOD置信区间为KASP-Z367-KASP-Z407-SWU18948,0.51cM,72,511bp;
qVW-D05-2的连锁群为LG_D05.2,位置为4.0000cM,2LOD置信区间为GH265-SWU17703-SWU17712,1.51cM,239,195bp;
qVW-D05-3的连锁群为LG_D05.2,位置为2.0000cM,2LOD置信区间为SWU17713-KASP-Z324-DPL0063,1.01cM,122,962bp;
qVW-A01-1的连锁群为LG_A01.1,位置为5.2cM,2LOD置信区间为KASP-Z427-KASP-Z005-KASP-Z428,0.51cM,14,954bp。
3.根据权利要求2所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点紧密连锁的KASP引物,其特征在于:KASP-Z367标记的连锁位置为53.5400cM,物理位置为62,509,658bp,QTL间距为0.2598cM;
KASP-Z407标记的连锁位置为53.7900cM,物理位置为62,575,437bp,QTL间距为0.0098cM;
KASP-Z324标记的连锁位置为2.03cM,物理位置为2,434,594bp,QTL间距为0.03cM;
KASP-Z427标记的连锁位置为4.76cM,物理位置为116,707,120bp,QTL间距为0.44cM;
KASP-Z005标记的连锁位置为5.27cM,物理位置为116,722,074bp,QTL间距为0.07cM;
KASP-Z428标记的连锁位置为5.27cM,物理位置为116,718,068bp,QTL间距为0.07cM。
4.权利要求1-3任一所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点紧密连锁的KASP引物的应用,其特征在于:进行单个抗黄萎病主效QTL的分子标记辅助筛选,筛选抗病纯合等位基因型的材料和感病纯合等位基因型的材料。
5.权利要求1-3任一所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点紧密连锁的KASP引物的应用,其特征在于:进行多个抗黄萎病主效QTL的分子聚合筛选,筛选聚合多个抗黄萎病主效QTL位点的材料。
6.权利要求1-3任一所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点紧密连锁的KASP引物的应用,其特征在于:对感黄萎病的棉花品种进行抗黄萎病性状的快速分子改良。
7.权利要求1-3任一所述的棉花抗黄萎病主效QTL位点紧密连锁的KASP引物的应用,其特征在于:筛选得到含有抗黄萎病QTL的抗病自交系RIL-2、RIL-5、RIL-8、RIL-10、RIL-12、RIL-13、RIL-14、RIL-19、RIL-31、RIL-32、RIL-68、RIL-69、RIL-78、RIL-82、RIL-89、RIL-90、RIL-92、RIL-96、RIL-97、RIL-109、RIL-114、RIL-125、RIL-131、RIL-132、RIL-143、RIL-133、RIL-150、RIL-218。
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