[发明专利]一种MGI平台转座酶双端标签文库的制备有效
申请号: | 202210486024.7 | 申请日: | 2022-05-06 |
公开(公告)号: | CN114836415B | 公开(公告)日: | 2023-04-18 |
发明(设计)人: | 聂俊伟;瞿志鹏;曹林;张宇;朱涵雪 | 申请(专利权)人: | 南京诺唯赞生物科技股份有限公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6806;C40B50/06;C12Q1/6869 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 210046 江苏省南京市南京经济*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 mgi 平台 转座酶双端 标签 文库 制备 | ||
1.一种寡核苷酸对,其包含第一寡核苷酸和第二寡核苷酸,其中:
第一寡核苷酸自5’端向3’端方向包含第一双端文库夹板序列、第一标签序列、修饰的单端文库夹板全序列和第一衔接序列,
第二寡核苷酸自5’端向3’端方向包含第二双端文库夹板序列、第二标签序列和第二衔接序列,第一双端文库夹板序列是
5’-CTCTCAGTACGTCAGCAGTT-3’(SEQ ID NO:7)所示序列,第二双端文库夹板序列是5’-GCATGGCGACCTTATCAG-3’(SEQ ID NO:8)所示序列,单端文库夹板全序列是
5’-CAACTCCTTGGCTCACAGAACGACATGGCTACGATCCGACTT-3’
(SEQ ID NO:9)所示序列,修饰的单端文库夹板全序列中的修饰包含3’端核苷酸缺失7、8、9、10、11、12或13个,
第一衔接序列与第三寡核苷酸的第一转座引物结合序列互补,第二衔接序列与第四寡核苷酸的第二转座引物结合序列互补,或者,第一衔接序列与第四寡核苷酸的第二转座引物结合序列互补,第二衔接序列与第三寡核苷酸的第一转座引物结合序列互补,
第三寡核苷酸自5’端向3’端方向包含第一转座酶识别序列和第一转座引物结合序列,第四寡核苷酸自5’端向3’端方向包含第二转座酶识别序列和第二转座引物结合序列,第一转座引物结合序列是
5’-TCGTCGGCAGCGTC-3’(SEQ ID NO:2)所示序列的反向互补序列,第二转座引物结合序列是5’-GTCTCGTGGGCTCGG-3’(SEQ ID NO:3)所示序列的反向互补序列,
第一寡核苷酸和第二寡核苷酸为单链。
2.根据权利要求1所述的寡核苷酸对,其中,第一标签序列和/或第二标签序列独立是1-20个连续任意核苷酸。
3.根据权利要求2所述的寡核苷酸对,其中,第一标签序列和/或第二标签序列独立是4-16个连续任意核苷酸。
4.根据权利要求3所述的寡核苷酸对,其中,第一标签序列和/或第二标签序列独立是4、6、8、10、12或16个连续任意核苷酸。
5.根据权利要求1所述的寡核苷酸对,其中,修饰的单端文库夹板全序列是5’-CAACTCCTTGGCTCACAGAACGACATGGC-3’(SEQ ID NO:11)所示序列。
6.根据权利要求1所述的寡核苷酸对,其中,修饰的单端文库夹板全序列中的修饰还包含5’端核苷酸缺失或替代。
7.根据权利要求6所述的寡核苷酸对,其中,修饰的单端文库夹板全序列中的修饰包含的5’端核苷酸缺失或替代是1、2、3、4或5个核苷酸的缺失或替代。
8.根据权利要求1所述的寡核苷酸对,其中,修饰的单端文库夹板全序列中的修饰还包含5’端添加GAAGACAA。
9.根据权利要求1所述的寡核苷酸对,其中,第一转座酶识别序列和第二转座酶识别序列是5’-CTGTCTCTTATACACATCT-3’(SEQ ID NO:1)所示序列。
10.根据权利要求1所述的寡核苷酸对,其中,第一寡核苷酸为正链,第二寡核苷酸为正链。
11.根据权利要求5所述的寡核苷酸对,其中第一衔接序列与第三寡核苷酸的第一转座引物结合序列互补,第二衔接序列与第四寡核苷酸的第二转座引物结合序列互补。
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