[发明专利]一种用于检测鰤诺卡氏菌的RPA引物、探针以及检测方法有效
申请号: | 202210535699.6 | 申请日: | 2022-05-18 |
公开(公告)号: | CN114634990B | 公开(公告)日: | 2022-09-09 |
发明(设计)人: | 谭爱萍;涂传明;邓玉婷;赵飞;黄志斌 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院珠江水产研究所;广州奕昕生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/365 |
代理公司: | 广州专理知识产权代理事务所(普通合伙) 44493 | 代理人: | 张凤 |
地址: | 510380 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 鰤诺卡氏菌 rpa 引物 探针 以及 方法 | ||
1.一种用于检测鰤诺卡氏菌的RPA检测组合,其特征在于,所述检测组合包括RPA引物和探针;
所述RPA引物F和R的核酸序列分别如序列表SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示:
引物F:5’-CGCGGATGTGGGCCACAACGTCGAACGCCT-3’;
引物R:5’-GGAACCCGTGAAAATGCGAGTGATCAGTGG-3’;
所述探针根据所述的RPA引物设计得到,所述探针的大小为30~45bp,其5’端用FAM标记,3’端进行C3 Spacer修饰,且在探针中间距离5’端30bp处进行THF修饰;
所述探针的核酸序列如序列表SEQ ID NO.3所示:
探针P:5’-FAM-AGATTGCGAATCGCCAAGTGCTCGTCCGCA[FAM-dT][THF][BHQ-dT]CGAACGGGGTCGTAG(C3 Spacer)-3’。
2.一种基于RPA法检测鰤诺卡氏菌的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求1所述的用于检测鰤诺卡氏菌的RPA检测组合。
3.一种非疾病诊断的基于RPA法检测鰤诺卡氏菌的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)提取待测样品中的DNA;
2)以步骤1)所提取的DNA为扩增模板,采用如权利要求1所述的引物F和R、探针P在RPA反应管中进行RPA扩增反应;
3)分析RPA扩增反应得到的产物。
4.根据权利要求3所述的非疾病诊断的基于RPA法检测鰤诺卡氏菌的方法,其特征在于,步骤2)所述RPA扩增反应的条件为:95℃,30秒,40℃,30秒,40个循环,95℃,1分钟终止反应。
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