[发明专利]一种文库标签引物的质控方法及其应用在审

专利信息
申请号: 202210543900.5 申请日: 2022-05-19
公开(公告)号: CN114807309A 公开(公告)日: 2022-07-29
发明(设计)人: 许腾;张俊杰;王欣瑶;张丽珍;李永军;王小锐 申请(专利权)人: 广州微远基因科技有限公司;广州微远医疗器械有限公司;广州微远医学检验实验室有限公司;深圳微远医疗科技有限公司;微远(深圳)医学研究中心有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C40B50/06;C12Q1/6869;C12Q1/686
代理公司: 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 代理人: 李海恬
地址: 510130 广东省广州市高新技术产业开发*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 文库 标签 引物 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种文库标签引物的质控方法,其特征在于,该质控方法包括以下步骤:

制备待检质控品:以区别于检测对象物种的基因序列作为质控模板序列,对所述质控模板序列进行滑动切割,切割窗口长度为100-1000bp,步长为50±25bp,得到若干拆分序列,将若干所述拆分序列比对至病原数据库,去除可匹配病原数据库的拆分序列,剩余序列即为特异性模板序列,针对若干所述特异性模板序列进行引物设计,分别得到对应的特异性扩增引物对,以所述特异性扩增引物对对所述质控模板序列的标准品进行PCR扩增,纯化富集,得到待检质控品;

构建第一文库:将所述待检质控品和质检合格的文库标签引物进行PCR扩增,得到第一文库;

第一质控:将所述第一文库进行测序,对测序后待检质控品数据进行质控分析,筛选出符合质控指标的质控品,即为合格的质控品,形成质控品集合;

构建第二文库:将所述质控品集合与待检接头引物序列进行PCR扩增,得到第二文库,所述待检接头引物序列包括待检文库标签引物、测序接头;

第二质控:将所述第二文库进行测序,对测序后待检接头引物序列数据进行质控分析,筛选出符合质控指标的文库标签引物,即为合格的文库标签引物。

2.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述第一质控还包括以下步骤:将质控分析不符合的质控品作为复检质控品,所述复检质控品重复进行所述构建第一文库步骤、所述第一质控步骤,筛选出合格的质控品。

3.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述第二质控还包括以下步骤:将质控分析不符合的文库标签引物作为复检文库标签引物,所述复检文库标签引物重复进行所述构建第二文库步骤、所述第二质控步骤,筛选出合格的文库标签引物。

4.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述构建第二文库步骤中,所述PCR扩增体系如下所示:

5.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述构建第二文库步骤中,所述PCR扩增程序如下所示:

重复98℃10s,60℃30s,72℃30s的过程10个循环

72℃ 5min

4℃ ∞。

6.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述引物设计的扩增子为100-600bp。

7.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述质控模板序列选自:植源性核酸序列或噬菌体核酸序列。

8.根据权利要求1-7中任一项所述的质控方法,其特征在于,所述质控指标包括:Cross_Contamination1/106、实验产出数据量/预期数据量>0.6、测序芯片数据拆分效率>0.85和编号一致性。

9.权利要求1-8中任一项所述质控方法得到的质控品。

10.权利要求9所述的质控品在转座酶法文库标签引物质控中的用途。

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