[发明专利]一种文库标签引物的质控方法及其应用在审
申请号: | 202210543900.5 | 申请日: | 2022-05-19 |
公开(公告)号: | CN114807309A | 公开(公告)日: | 2022-07-29 |
发明(设计)人: | 许腾;张俊杰;王欣瑶;张丽珍;李永军;王小锐 | 申请(专利权)人: | 广州微远基因科技有限公司;广州微远医疗器械有限公司;广州微远医学检验实验室有限公司;深圳微远医疗科技有限公司;微远(深圳)医学研究中心有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C40B50/06;C12Q1/6869;C12Q1/686 |
代理公司: | 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 | 代理人: | 李海恬 |
地址: | 510130 广东省广州市高新技术产业开发*** | 国省代码: | 广东;44 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 文库 标签 引物 方法 及其 应用 | ||
1.一种文库标签引物的质控方法,其特征在于,该质控方法包括以下步骤:
制备待检质控品:以区别于检测对象物种的基因序列作为质控模板序列,对所述质控模板序列进行滑动切割,切割窗口长度为100-1000bp,步长为50±25bp,得到若干拆分序列,将若干所述拆分序列比对至病原数据库,去除可匹配病原数据库的拆分序列,剩余序列即为特异性模板序列,针对若干所述特异性模板序列进行引物设计,分别得到对应的特异性扩增引物对,以所述特异性扩增引物对对所述质控模板序列的标准品进行PCR扩增,纯化富集,得到待检质控品;
构建第一文库:将所述待检质控品和质检合格的文库标签引物进行PCR扩增,得到第一文库;
第一质控:将所述第一文库进行测序,对测序后待检质控品数据进行质控分析,筛选出符合质控指标的质控品,即为合格的质控品,形成质控品集合;
构建第二文库:将所述质控品集合与待检接头引物序列进行PCR扩增,得到第二文库,所述待检接头引物序列包括待检文库标签引物、测序接头;
第二质控:将所述第二文库进行测序,对测序后待检接头引物序列数据进行质控分析,筛选出符合质控指标的文库标签引物,即为合格的文库标签引物。
2.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述第一质控还包括以下步骤:将质控分析不符合的质控品作为复检质控品,所述复检质控品重复进行所述构建第一文库步骤、所述第一质控步骤,筛选出合格的质控品。
3.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述第二质控还包括以下步骤:将质控分析不符合的文库标签引物作为复检文库标签引物,所述复检文库标签引物重复进行所述构建第二文库步骤、所述第二质控步骤,筛选出合格的文库标签引物。
4.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述构建第二文库步骤中,所述PCR扩增体系如下所示:
5.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述构建第二文库步骤中,所述PCR扩增程序如下所示:
重复98℃10s,60℃30s,72℃30s的过程10个循环
72℃ 5min
4℃ ∞。
6.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述引物设计的扩增子为100-600bp。
7.根据权利要求1所述的质控方法,其特征在于,所述质控模板序列选自:植源性核酸序列或噬菌体核酸序列。
8.根据权利要求1-7中任一项所述的质控方法,其特征在于,所述质控指标包括:Cross_Contamination1/106、实验产出数据量/预期数据量>0.6、测序芯片数据拆分效率>0.85和编号一致性。
9.权利要求1-8中任一项所述质控方法得到的质控品。
10.权利要求9所述的质控品在转座酶法文库标签引物质控中的用途。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于广州微远基因科技有限公司;广州微远医疗器械有限公司;广州微远医学检验实验室有限公司;深圳微远医疗科技有限公司;微远(深圳)医学研究中心有限公司,未经广州微远基因科技有限公司;广州微远医疗器械有限公司;广州微远医学检验实验室有限公司;深圳微远医疗科技有限公司;微远(深圳)医学研究中心有限公司许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202210543900.5/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇:二氧化锆基氧传感器用电极铂浆的制备及烧结方法
- 下一篇:防回吸装置及牙科设备