[发明专利]用于检测CHIKV、DENV、ZIKV分型区基因组的引物组合及检测方法在审
申请号: | 202210607946.9 | 申请日: | 2022-05-31 |
公开(公告)号: | CN114807448A | 公开(公告)日: | 2022-07-29 |
发明(设计)人: | 刘丽;赵恒;冯悦;夏雪山 | 申请(专利权)人: | 昆明理工大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12Q1/6869;C40B50/06;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 昆明同聚专利代理有限公司 53214 | 代理人: | 苏芸芸 |
地址: | 650093 云*** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 chikv denv zikv 分型区 基因组 引物 组合 方法 | ||
1.一种用于检测CHIKV、DENV、ZIKV分型区基因组的引物组合,其特征在于:包括用于CHIKV、DENV、ZIKV RNA逆转录的特异性引物、扩增分型区基因组的引物。
2.根据权利要求1所述的用于检测CHIKV、DENV、ZIKV分型区基因组的引物组合,其特征在于:用于ZIKV RNA逆转录的特异性引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:69 - SEQ ID NO:86所示,用于CHIKV RNA逆转录的特异性引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:87 - SEQ ID NO:99所示,用于DENV RNA逆转录的特异性引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:100- SEQ ID NO:151所示。
3.根据权利要求1所述的用于检测CHIKV、DENV、ZIKV分型区基因组的引物组合,其特征在于:扩增ZIKV分型区基因组的引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1- SEQ ID NO:12所示,扩增CHIKV分型区基因组的引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:13- SEQ ID NO:22所示,扩增DENV分型区基因组的引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:23- SEQ ID NO:68所示。
4.采用权利要求1所述的用于检测CHIKV、DENV、ZIKV分型区基因组的引物组合检测病毒的方法,其特征在于:提取样品RNA,以提取的RNA为模板,采用用于病毒RNA逆转录的特异性引物逆转录出cDNA;然后以cDNA为模板,采用多重PCR方法扩增靶基因;构建靶基因文库,对所得文库进行二代测序,通过二代测序技术进行突变位点筛查和病毒分型。
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