[发明专利]一种吸污防霾林木多性状育种方法在审
| 申请号： | 202210617202.5 | 申请日： | 2022-06-01 |
| 公开（公告）号： | CN114807426A | 公开（公告）日： | 2022-07-29 |
| 发明（设计）人： | 余晴;栗梦真;李依阳;李官燕;岳肖晨;赫倚风;陈香萌;彭万喜 | 申请（专利权）人： | 河南农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;G06K9/62;G16B20/30;G16B50/30 |
| 代理公司： | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人： | 李峥嵘 |
| 地址： | 450002 河*** | 国省代码： | 河南;41 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 吸污防霾 林木 性状 育种 方法 | ||
1.一种吸污防霾林木多性状育种方法，其特征在于：包括以下步骤：
S1取林木样品，进行测序分析，得到clean reads；
S2将步骤S1中得到的clean reads与参考基因组进行比对，提取SNP信息数据集；
S3过滤步骤S2得到的SNP信息数据集，得到高质量SNP数据亚集；
S4计算获得候选育种亲本的遗传距离矩阵，以构建SNP聚类树；
S5选择吸污防霾相关基因位点，提取SNP信息；
S6将S5中的SNP信息整合成单倍型HT变异信息，从候选亲本中筛选获得用于表型鉴定的亲本子集；
S7从亲本子集中选择育种的亲本；
S8将亲本对应的林木进行栽培，在林木主茎高50-100cm处截断林木；
S9在截断处涂覆真菌菌液，20-30天后，选择出无病害的林木。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述测序分析包括将clean reads与以下数据库进行分类注释：Rfam数据库、cDNA序列、物种重复序列库、miRBase数据库。
3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤S3中，过滤SNP信息数据集采用以下标准：
(1)p值小于0.02；
(2)任意两样品中至少有一个的TPM值大于10；
(3)foldChange值大于5，foldChange值＝TPMSaple_ZZ./TPMSample_ZW。
4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤S4中，还包括根据SNP聚类树，判断候选育种亲本之间的亲缘关系远近，依据基因组相似性进行亲本分组的步骤。
5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤S5中，提取SNP信息的方法，包括从候选亲本中提取具有吸污防霾基因所对应的SNP信息。
6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤S8中，还包括将亲本对应的林木栽培在雾霾严重的区域。
7.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：所述真菌菌液包括白腐菌菌液、煤炱目菌液和松芍柱锈菌中的至少一种。
8.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤S9中，还包括涂覆真菌菌液2-3天后，在林木截断处涂覆抗菌素。
9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于：所述抗菌素包括卡那霉素和氨苄青霉素中的至少一种。
10.如权利要求1至9任一项所述的一种吸污防霾林木多性状育种方法在林木遗传育种中的应用。
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