[发明专利]一种辅助选择水稻抗细菌性条斑病基因位点qBLS4.1的InDel分子标记及其应用

权利要求书

1.一种用于检测水稻抗细菌性条斑病位点qBLS4.1的特异性引物组合，其特征在于，具体序列如SEQ ID No.1～SEQ ID No.2所示或如SEQ ID No.3～SEQ IDNo.4所示。

2.一种用于检测水稻抗细菌性条斑病位点qBLS4.1的分子标记，其特征在于，所述分子标记为C4MJ1或C4MJ3；所述分子标记C4MJ1的引物序列如SEQ IDNo.1～2所示；所述分子标记C4MJ3的引物序列如SEQ ID No.3～4所示。

3.一种含有权利要求1所述的引物组合的试剂盒。

4.权利要求1所述的引物组合或权利要求2所述的分子标记或权利要求3所述的试剂盒在水稻育种中的应用。

5.权利要求1所述的引物组合或权利要求2所述的分子标记或权利要求3所述的试剂盒在快速筛选抗细菌性条斑病品种或者品系中的应用。

6.一种水稻抗细菌性条斑病位点qBLS4.1的分子标记用于检测水稻抗细菌性条斑病的方法，其特征在于，用分子标记C4MJ1引物或分子标记C4MJ3引物扩增水稻品种或育种材料DNA，如果用分子标记C4MJ1引物能够扩增出217bp扩增片段或用分子标记C4MJ3引物能够扩增出313bp扩增片段，则标志着水稻品种或育种材料中存在抗细菌性条斑病位点qBLS4.1；所述分子标记C4MJ1的引物序列如SEQ ID No.1～2所示；所述分子标记C4MJ3的引物序列如SEQ IDNo.3～4所示。

7.一种权利要求2所述的分子标记的筛选方法，其特征在于，包括以下步骤：

(1)以抗病材料广西普通野生稻WP1为父本，感病材料9311为母本，杂交获得F₁，收获F₁代种子后多代自交，构建了一套水稻F_8:9分离群体；

(2)对两个亲本及其衍生的F_8:9群体进行细菌性条斑病的人工接种抗性鉴定；

(3)在F_8:9群体中选取极抗和极感样本，提取DNA，利用QTL-Seq技术对水稻抗细菌性条斑病基因进行基因定位；

(4)在初定位区间，开发InDel分子标记，利用遗传连锁分析技术，结合分子标记带型及抗性表型数据，将目标基因限定在两个分子标记C4MJ1和C4MJ3之间；

(5)获得抗细菌性条斑病位点qBLS4.1一个，使用所述分子标记C4MJ1和C4MJ3来检测抗性材料WP1衍生的品种(系)中是否含有该主基因位点，预测其细菌性条斑病抗性水平。

8.如权利要求7所述的筛选方法，其特征在于，所述步骤(3)中基因定位于第4染色体上。