[发明专利]用于PWS印记区基因表达分析的多重PCR检测方法在审
申请号: | 202210701661.1 | 申请日: | 2022-06-21 |
公开(公告)号: | CN114959015A | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
发明(设计)人: | 赵艳辉;孙晓;王晓彩;庞泓 | 申请(专利权)人: | 沈阳市妇婴医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 沈阳东大知识产权代理有限公司 21109 | 代理人: | 马海芳 |
地址: | 110010 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 pws 印记 基因 表达 分析 多重 pcr 检测 方法 | ||
1.一种用于PWS印记区基因表达分析的多重PCR检测方法,其特征在于,其特征在于,包括选择检测的组织类型、检测项目及内容、判断标准;
组织类型:胎盘组织;
检测项目及内容:对胎盘组织中的mRNA进行提取,进行MAGEL2基因的PCR检测;所述PCR检测过程还包括引入内参基因ACTB,选择扩增片段,设定与MAGEL2基因扩增产物相近的Tm值;
判断标准:
对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,检测结果:若内参基因ACTB有扩增条带,同时MAGEL2有扩增条带,则间接证明染色体15q11.2-q13印记区域有表达;若内参基因ACTB有扩增条带,同时MAGEL2无扩增条带,则间接证明染色体15q11.2-q13印记区域无表达。
2.根据权利要求1所述的用于PWS印记区基因表达分析的多重PCR检测方法,其特征在于,内参基因引物序列:
序列(5'-3')
上游引物:CATGTACGTTGCTATCCAGGC
引物长度:21bp
模板起始位置:477
模板终止位置:497
Tm:59.13℃
GC:52.38%
下游引物:CTCCTTAATGTCACGCACGAT
引物长度:21bp
模板起始位置:706
模板终止位置:726
Tm:58.46℃
GC:47.62%
目标产物
NM_001101.5Homo sapiens actin beta(ACTB),mRNA
产物长度=250bp。
3.根据权利要求1所述的用于PWS印记区基因表达分析的多重PCR检测方法,其特征在于,MAGEL2基因引物序列:
序列(5'-3')
上游引物:CCTGGGCTCCGCTAAATCATT
引物长度:21bp
模板起始位置:2246
模板终止位置:2266
Tm:60.48℃
GC:52.38%
下游引物:TCATGCGGTCTTTTGAAGGGG
引物长度:21bp
模板起始位置:2356
模板终止位置:2376
Tm:60.89℃
GC:52.38%
目标产物
NM_019066.5Homo sapiens MAGE family member L2(MAGEL2),mRNA
产物长度=131bp。
4.根据权利要求1所述的用于PWS印记区基因表达分析的多重PCR检测方法,其特征在于,所述PCR扩增反应体系及反应条件如下:
反应体系:
将cDNA模板1-4μl,引物0.5-2μl,dNTP 0.5-2μl,10xPCR缓冲液2.5-10μl,MgCl2溶液2.0-8μl,Taq DNA聚合酶1-4U混合,加水补足至25-100μl;其中,cDNA模板浓度为20-1000ng/μl,引物浓度为5μM,dNTP浓度为10mM,MgCl2溶液浓度为25mmol/L;
反应条件:
95℃起始变性4min;95℃变性40sec,58-61℃退火40sec,72℃延伸40sec,35个循环;72℃延伸10min。
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