[发明专利]用于PWS印记区基因表达分析的多重PCR检测方法在审

专利信息
申请号: 202210701661.1 申请日: 2022-06-21
公开(公告)号: CN114959015A 公开(公告)日: 2022-08-30
发明(设计)人: 赵艳辉;孙晓;王晓彩;庞泓 申请(专利权)人: 沈阳市妇婴医院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 沈阳东大知识产权代理有限公司 21109 代理人: 马海芳
地址: 110010 辽*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 用于 pws 印记 基因 表达 分析 多重 pcr 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种用于PWS印记区基因表达分析的多重PCR检测方法,其特征在于,其特征在于,包括选择检测的组织类型、检测项目及内容、判断标准;

组织类型:胎盘组织;

检测项目及内容:对胎盘组织中的mRNA进行提取,进行MAGEL2基因的PCR检测;所述PCR检测过程还包括引入内参基因ACTB,选择扩增片段,设定与MAGEL2基因扩增产物相近的Tm值;

判断标准:

对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,检测结果:若内参基因ACTB有扩增条带,同时MAGEL2有扩增条带,则间接证明染色体15q11.2-q13印记区域有表达;若内参基因ACTB有扩增条带,同时MAGEL2无扩增条带,则间接证明染色体15q11.2-q13印记区域无表达。

2.根据权利要求1所述的用于PWS印记区基因表达分析的多重PCR检测方法,其特征在于,内参基因引物序列:

序列(5'-3')

上游引物:CATGTACGTTGCTATCCAGGC

引物长度:21bp

模板起始位置:477

模板终止位置:497

Tm:59.13℃

GC:52.38%

下游引物:CTCCTTAATGTCACGCACGAT

引物长度:21bp

模板起始位置:706

模板终止位置:726

Tm:58.46℃

GC:47.62%

目标产物

NM_001101.5Homo sapiens actin beta(ACTB),mRNA

产物长度=250bp。

3.根据权利要求1所述的用于PWS印记区基因表达分析的多重PCR检测方法,其特征在于,MAGEL2基因引物序列:

序列(5'-3')

上游引物:CCTGGGCTCCGCTAAATCATT

引物长度:21bp

模板起始位置:2246

模板终止位置:2266

Tm:60.48℃

GC:52.38%

下游引物:TCATGCGGTCTTTTGAAGGGG

引物长度:21bp

模板起始位置:2356

模板终止位置:2376

Tm:60.89℃

GC:52.38%

目标产物

NM_019066.5Homo sapiens MAGE family member L2(MAGEL2),mRNA

产物长度=131bp。

4.根据权利要求1所述的用于PWS印记区基因表达分析的多重PCR检测方法,其特征在于,所述PCR扩增反应体系及反应条件如下:

反应体系:

将cDNA模板1-4μl,引物0.5-2μl,dNTP 0.5-2μl,10xPCR缓冲液2.5-10μl,MgCl2溶液2.0-8μl,Taq DNA聚合酶1-4U混合,加水补足至25-100μl;其中,cDNA模板浓度为20-1000ng/μl,引物浓度为5μM,dNTP浓度为10mM,MgCl2溶液浓度为25mmol/L;

反应条件:

95℃起始变性4min;95℃变性40sec,58-61℃退火40sec,72℃延伸40sec,35个循环;72℃延伸10min。

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