[发明专利]用于烟草缺锌营养诊断的基因标志物集及其应用在审

专利信息
申请号: 202210773990.7 申请日: 2022-07-01
公开(公告)号: CN116004877A 公开(公告)日: 2023-04-25
发明(设计)人: 李文卿;陈松彪;唐唯其;曲梦宇;郭金平;陆建军;柯玉琴;李春英;谢榕榕;梁廷敏;叶蓉蓉;迟文超;王月敏;高静娟;朱晨宇 申请(专利权)人: 福建省烟草专卖局烟草科学研究所;闽江学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 福州元创专利商标代理有限公司 35100 代理人: 林文弘;蔡学俊
地址: 350013 福建*** 国省代码: 福建;35
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摘要:
搜索关键词: 用于 烟草 营养 诊断 基因 标志 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种用于烟草缺锌营养诊断的基因标志物集,其特征在于:所述基因标志物集由Nitab4.5_0000143g0340、Nitab4.5_0000572g0110、Nitab4.5_0003605g0060、Nitab4.5_0001724g0060、Nitab4.5_0006169g0020组成,Nitab4.5_0000143g0340的核苷酸序列如SEQID NO:1所示,Nitab4.5_0000572g0110的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示,Nitab4.5_0003605g0060的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,Nitab4.5_0001724g0060的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示,Nitab4.5_0006169g0020的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示。

2.如权利要求1所述的基因标志物集在烟草缺锌营养诊断中的应用。

3.一种烟草缺锌营养诊断试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括通过RT-qPCR技术检测权利要求1所述的基因标志物集的试剂。

4.根据权利要求3所述的烟草缺锌营养诊断试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括特异性检测Nitab4.5_0000143g0340、Nitab4.5_0000572g0110、Nitab4.5_0003605g0060、Nitab4.5_0001724g0060、Nitab4.5_0006169g0020的引物。

5.根据权利要求4所述的烟草缺锌营养诊断试剂盒,其特征在于:所述特异性检测Nitab4.5_0000143g0340、Nitab4.5_0000572g0110、Nitab4.5_0003605g0060、Nitab4.5_0001724g0060、Nitab4.5_0006169g0020的引物的序列如下:

Nitab4.5_0000143g0340的特异性引物:

RT-0143-F: 5ʹ-CGGCTTGTTACACCTCATTACTC-3ʹ,

RT-0143-R: 5ʹ-TTCACCACTTGCTTCAACTCTTC-3ʹ;

Nitab4.5_0000572g0110的特异性引物:

RT-0572-F: 5ʹ-GATAGACCTCTTGCTTCC-3ʹ,

RT-0572-R: 5ʹ-GATTAGTTGCTTGTGATGG-3ʹ;

Nitab4.5_0003605g0060的特异性引物:

RT-3605-F: 5ʹ-TTCAGCAAGAGTAATTGTTG-3ʹ,

RT-3605-R: 5ʹ- ATTCGGAAGTTCGTCAAG-3ʹ;

Nitab4.5_0001724g0060的特异性引物:

RT-1724-F: 5ʹ-GCTTCAGTCATTCCTTAG-3ʹ,

RT-1724-R: 5ʹ-TGCTGTCAATATCATCCT-3ʹ;

Nitab4.5_0006169g0020的特异性引物:

RT-6169-F: 5ʹ-TCTCACTTACAACTCCAG-3ʹ,

RT-6169-R: 5ʹ- AATACTCCTTCCACAATGA-3ʹ。

6.如权利要求3所述的烟草缺锌营养诊断试剂盒在烟草缺锌营养诊断中的应用。

7.一种烟草缺锌营养诊断的方法,其特征在于:包括如下步骤:

1)采集待测烟草叶片,提取总RNA,反转录成cDNA;

2)以反转录得到的cDNA为模板,利用权利要求5中所述的特异性引物进行RT-qPCR检测,根据基因是否上调表达判断待测烟草是否处于缺锌胁迫。

8.根据权利要求7所述的烟草缺锌营养诊断的方法,其特征在于:若待测烟草中Nitab4.5_0000143g0340、Nitab4.5_0000572g0110、Nitab4.5_0003605g0060、Nitab4.5_0001724g0060、Nitab4.5_0006169g0020的表达较正常烟草显著上调,则该待测烟草处于缺锌胁迫状态。

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