[发明专利]用于烟草缺锌营养诊断的基因标志物集及其应用

说明书

本发明公开了一种用于烟草缺锌营养诊断的基因标志物集及其应用，属于生物技术领域。所述基因标志物集由Nitab4.5_0000143g0340、Nitab4.5_0000572g0110、Nitab4.5_0001724g0060、Nitab4.5_0003605g0060和Nitab4.5_0006169g0020组成。该基因标志物集在烟草应答缺锌胁迫中特异性显著上调表达，可以诊断烟草缺锌胁迫。本发明为建立基于基因标志物的烟草缺锌快速诊断方法具有借鉴意义。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及一种用于烟草缺锌营养诊断的基因标志物集及其应用。

背景技术

烟草（ Nicotiana tabacum L.）是一年生或有限多年生茄科烟草属植物，具有很高的经济价值和药用价值。在全世界，烟草被广泛种植。为了保证烟草的正常生长发育，需要提供多种营养元素。锌（Zn²⁺）是烟草正常生长发育必需的微量元素之一。锌参与植物体内多种酶的合成、参与叶绿素的合成，锌还是合成生长素前体色氨酸的重要物质。锌缺乏会影响众多酶的活性，同时还会影响植物的光合作用，导致植物多糖合成能力下降。锌的缺乏还会影响植物发育，导致植株矮小、生长减缓等等症状。

以高通量测序技术为基础的基因组学策略可以更加精准、高效地挖掘和筛选烟草应答缺锌胁迫的分子生物标志物，建立基于生物标志的营养诊断方法，为构建烟草绿色种植体系提供新方法和新思路。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种用于烟草缺锌营养诊断的基因标志物集及其应用。

为实现上述目的，本发明提供了如下方案：

本发明首先提供了一种用于烟草缺锌营养诊断的基因标志物集，所述基因标志物集由Nitab4.5_0000143g0340、Nitab4.5_0000572g0110、Nitab4.5_0003605g0060、Nitab4.5_0001724g0060和Nitab4.5_0006169g0020组成，Nitab4.5_0000143g0340的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，Nitab4.5_0000572g0110的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示，Nitab4.5_0003605g0060的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示，Nitab4.5_0001724g0060的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示，Nitab4.5_0006169g0020的核苷酸序列如SEQ ID NO:5所示。

本发明还提供了上述一种基因标志物集在烟草缺锌营养诊断中的应用。

本发明还提供了一种烟草缺锌营养诊断试剂盒，所述试剂盒包括通过RT-qPCR技术检测上所述的基因标志物集的试剂。

进一步的，上述试剂盒包括特异性检测Nitab4.5_0000143g0340、Nitab4.5_0000572g0110、Nitab4.5_0003605g0060、Nitab4.5_0001724g0060、Nitab4.5_0006169g0020的引物。

进一步的，上述特异性检测Nitab4.5_0000143g0340、Nitab4.5_0000572g0110、Nitab4.5_0003605g0060、Nitab4.5_0001724g0060、Nitab4.5_0006169g0020的引物的序列如下：

Nitab4.5_0000143g0340的特异性引物：

RT-0143-F: 5ʹ-CGGCTTGTTACACCTCATTACTC-3ʹ，

RT-0143-R: 5ʹ-TTCACCACTTGCTTCAACTCTTC-3ʹ；

Nitab4.5_0000572g0110的特异性引物：

RT-0572-F: 5ʹ-GATAGACCTCTTGCTTCC-3ʹ，