[发明专利]全类型生物蛋白质组学样本保存及自动化前处理方法在审
申请号: | 202210792083.7 | 申请日: | 2022-07-07 |
公开(公告)号: | CN115184110A | 公开(公告)日: | 2022-10-14 |
发明(设计)人: | 成晓亮;李琦;周岳;张伟;郑可嘉 | 申请(专利权)人: | 江苏品生医疗科技集团有限公司;南京品生医疗科技有限公司 |
主分类号: | G01N1/28 | 分类号: | G01N1/28;G01N1/42;G01N30/06;G01N30/34;G01N30/72 |
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地址: | 210000 江苏省南京市江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 类型 生物 蛋白质 样本 保存 自动化 处理 方法 | ||
1.一种全类型生物蛋白质组学样本保存及自动化前处理方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
步骤一,蛋白裂解:基于自动化处理工作站,将全类型生物样本与蛋白裂解液按照100μL~500μL的体系进行充分混合,裂解提取蛋白,其中,所述蛋白裂解液为0.1~10%脱氧胆酸钠;
步骤二,还原烷基化:加入终浓度为10-1000mM的还原烷基化试剂,打开蛋白结构中二硫键并与蛋白游离巯基结合,暴露出尽可能多的酶切位点;
步骤三,蛋白酶解:根据样品蛋白量与蛋白酶质量比1:5~10的比例混合,将蛋白酶解成多个小的肽段;
步骤四,肽段脱盐:将酶解后的肽段-酸性终止液溶液,转移至填充有具有阳离子交换作用的固相萃取板,加入质量分数为1%的三氟乙酸异丙醇溶液和加入质量分数为0.2%的三氟乙酸溶液进行脱盐洗涤,最后加入碱性乙腈溶液洗脱,收集含有肽段的洗脱液,以得到进行质谱检测进样的样品;
步骤五,冻干复溶:滤液冻干复溶后,待质谱检测分析。
2.根据权利要求1所述的全类型生物蛋白质组学样本保存及自动化前处理方法,其特征在于,所述步骤二中,所述还原烷基化试剂为三(2-羧乙基)膦盐酸盐、氯乙酰胺。
3.根据权利要求1所述的全类型生物蛋白质组学样本保存及自动化前处理方法,其特征在于,所述步骤三中,所述蛋白酶为胰蛋白酶和赖氨酸酶。
4.根据权利要求1所述的全类型生物蛋白质组学样本保存及自动化前处理方法,其特征在于,所述步骤一中,蛋白裂解的时间为5分钟;所述步骤二中,还原烷基化的时间为30分钟;所述步骤三中,蛋白酶解的时间为120分钟;所述步骤四中,肽段脱盐的时间为30分钟;所述步骤五中,冻干复溶的时间为40分钟。
5.根据权利要求1所述的全类型生物蛋白质组学样本保存及自动化前处理方法,其特征在于,所述步骤一包括:
自动移取生物样本10μL置于0.5mL 96孔板中并放置在1号位的恒温混匀摇床上,再从7号位的12道槽第1列中吸取90μL 0.1%脱氧胆酸钠分别加入1号位的恒温混匀摇床上的0.5mL 96孔板中,1000rpm转速涡旋混匀,提取蛋白。
6.根据权利要求1所述的全类型生物蛋白质组学样本保存及自动化前处理方法,其特征在于,所述步骤二包括:从6号位的低温盘第1列中吸取10μL 0.5M氯乙酰胺和三(2-羧乙基)膦盐酸盐的混合物,分别加入1号位的恒温混匀摇床上的0.5mL 96孔板中,氯乙酰胺和三(2-羧乙基)膦盐酸盐的终浓度分别为10mM和40mM,1000rpm转速涡旋混匀,37℃反应30min。
7.根据权利要求1所述的全类型生物蛋白质组学样本保存及自动化前处理方法,其特征在于,所述步骤三包括:从6号位的低温盘中第2列吸取10μL 2μg混合的胰蛋白酶和赖氨酸酶,分别加入1号位的恒温混匀摇床上的0.5mL 96孔板中,进行37℃、1000rpm转速震荡孵育2h,孵育结束后,再从7号位的12道槽第2列中吸取100μL 1%三氟乙酸/异丙醇溶剂,加入1号位的恒温混匀摇床上的0.5mL 96孔板中,1000rpm转速震荡孵育2min。
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