[发明专利]一种褐色脂肪组织和白色脂肪组织生物标志物及其应用在审
申请号: | 202210826817.9 | 申请日: | 2022-07-13 |
公开(公告)号: | CN114959070A | 公开(公告)日: | 2022-08-30 |
发明(设计)人: | 吴东海;李雷;聂涛;赵世亭;段子渊 | 申请(专利权)人: | 中国科学院广州生物医药与健康研究院 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6869;G16B20/30;G16B35/20 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 赵颖 |
地址: | 510530 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 褐色 脂肪 组织 白色 生物 标志 及其 应用 | ||
1.一种褐色脂肪组织和白色脂肪组织的生物标志物,其特征在于,所述生物标志物包括TFRC基因、STARD7基因、SMOC1基因、KLHDC7A基因、GK基因、FH基因、HMGB3基因、PRG4基因、GRM8基因、MAPK8IP2基因、CALB1基因、ZNF804A基因、CA12基因、TRAP1基因、ATP5G1基因、ATPAF1基因、PPA1基因、HR基因、RNF112基因、LMX1B基因、FMOD基因、TMEM119基因、GDF10基因、ADRA2A基因、HAND2基因、IRX1基因、HOXB6基因、HOXB8基因、UNC5C基因或FBLN7基因中的任意一种或至少两种的组合。
2.权利要求1所述褐色脂肪组织和白色脂肪组织的生物标志物在制备检测褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织产品中应用。
3.一种检测褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括检测权利要求1所述的褐色脂肪组织和白色脂肪组织的生物标志物的表达水平的试剂。
4.根据权利要求3所述的检测褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织的试剂盒,其特征在于,所述试剂包括RNA转录组检测试剂。
5.权利要求1所述褐色脂肪组织和白色脂肪组织的生物标志物在检测褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织中应用。
6.一种以非疾病诊断和/或治疗为目的的检测褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织的方法,其特征在于,所述方法包括:
对待测样本中RNA进行测序,根据测序结果分析权利要求1所述褐色脂肪组织和白色脂肪组织的生物标志物的每百万次读取的转录本TPM值,并按计算TPM值与RNA质量的比值S,进行判断是否是褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织。
7.根据权利要求6所述的以非疾病诊断和/或治疗为目的的检测褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织的方法,其特征在于,所述方法还包括提取待测样本中RNA的步骤;
优选地,所述测序前还包括构建文库的步骤。
8.根据权利要求6或7所述的以非疾病诊断和/或治疗为目的的检测褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织的方法,其特征在于,所述判断的标准包括:
判断是褐色脂肪组织的标准为:TFRC基因的S值≥8.66、STARD7基因的S值≥52.37、SMOC1基因的S值≥26.34、KLHDC7A基因的S值≥0.08、GK基因的S值≥32.22、FH基因的S值≥142.48、HMGB3基因的S值≥61.87、PRG4基因的S值≥10.55、GRM8基因的S值≥0.3、MAPK8IP2基因的S值≥1.23、CALB1基因的S值≥0.3、ZNF804A基因的S值≥0.04、CA12基因的S值≥2.35、TRAP1基因的S值≥98.11、ATP5G1基因的S值≥278.34、ATPAF1基因的S值≥24.52、PPA1基因的S值≥228.03或HR基因的S值≥2.64中的任意一种或至少两种的组合;
判断是白色脂肪组织的标准为:RNF112基因的S值≥16.57、LMX1B基因的S值≥0.9、FMOD基因的S值≥12.43、TMEM119基因的S值≥13.84、GDF10基因的S值≥3.64、ADRA2A基因的S值≥4.56、HAND2基因的S值≥2.42、IRX1基因的S值≥1.33、HOXB6基因的S值≥13.25、HOXB8基因的S值≥11.49、UNC5C基因的S值≥1.00或FBLN7基因的S值≥1.47中的任意一种或至少两种的组合。
9.根据权利要求6-8任一项所述的以非疾病诊断和/或治疗为目的的检测褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
(1)提取待测样本中RNA;
(2)利用所述RNA构建文库并进行测序;
(3)根据测序结果分析权利要求1所述褐色脂肪组织和白色脂肪组织的生物标志物的每百万次读取的转录本TPM值,计算TPM值与RNA质量的比值S,进行判断是否是褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织。
10.一种检测褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织的装置,其特征在于,所述装置包括检测单元和分析单元;
所述检测单元用于执行包括:对待测样本中RNA进行测序;
所述分析单元用于执行包括:
根据测序结果分析权利要求1所述褐色脂肪组织和白色脂肪组织的生物标志物的每百万次读取的转录本TPM值,计算TPM值与RNA质量的比值S,并进行判断是否是褐色脂肪组织和/或白色脂肪组织。
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