[发明专利]检测TLX1基因中目标区域的甲基化水平的试剂在制备食管癌诊断产品中的应用在审
申请号: | 202210846967.6 | 申请日: | 2022-07-06 |
公开(公告)号: | CN116121371A | 公开(公告)日: | 2023-05-16 |
发明(设计)人: | 周俊;董兰兰;张良禄;熊杨辉;郑义慧;赵巴丽;吴志诚 | 申请(专利权)人: | 武汉艾米森生命科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 王秉丽 |
地址: | 430000 湖北省武汉市武汉东湖新技术开发区高*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 tlx1 基因 目标 区域 甲基化 水平 试剂 制备 食管癌 诊断 产品 中的 应用 | ||
1.检测TLX1基因中的目标区域的甲基化水平的试剂在制备食管癌诊断产品中的应用;
以GRCh38.p14为参考基因组,所述目标区域为Chr10:101133915-101135295或者Chr10:101133915-101135295的部分区域。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂通过如下方法中的一种或多种实现对所述目标区域的甲基化水平的检测:甲基化特异性PCR、亚硫酸氢盐测序法、甲基化特异性微阵列法、全基因组甲基化测序法、焦磷酸测序法、甲基化特异性高效液相层析法、数字PCR法、甲基化特异性高分辨率溶解曲线法、甲基化敏感性限制性内切酶法和荧光定量法。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述试剂包括检测所述目标区域的甲基化水平的检测引物对及其对应的检测探针。
4.根据权利要求1至3任一项所述的应用,其特征在于,所述部分区域选自如下定义的区域1至区域11中的一个或者多个:
区域1为Chr10:101133915-101134052,正链,
区域2为Chr10:101134069-101134255,正链,
区域3为Chr10:101134283-101134399,正链,
区域4为Chr10:101134414-101134556,正链,
区域5为Chr10:101134768-101134867,正链,
区域6为Chr10:101134881-101134969,正链,
区域7为Chr10:101135295-101135138,负链,
区域8为Chr10:101134947-101134788,负链,
区域9为Chr10:101134493-101134344,负链,
区域10为Chr10:101134336-101134178,负链,
区域11为Chr10:101134072-101133926,负链。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述试剂包括:
检测所述区域1的如SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.24所示的检测引物对及其对应的如SEQ ID NO.25所示的检测探针;或/和,
检测所述区域2的如SEQ ID NO.26和SEQ ID NO.27所示的检测引物对及其对应的如SEQ ID NO.28所示的检测探针;或/和,
检测所述区域3的如SEQ ID NO.29和SEQ ID NO.30所示的检测引物对及其对应的如SEQ ID NO.31所示的检测探针;或/和,
检测所述区域4的如SEQ ID NO.32和SEQ ID NO.33所示的检测引物对及其对应的如SEQ ID NO.34所示的检测探针;或/和,
检测所述区域5的如SEQ ID NO.35和SEQ ID NO.36所示的检测引物对及其对应的如SEQ ID NO.37所示的检测探针;或/和,
检测所述区域6的如SEQ ID NO.38和SEQ ID NO.39所示的检测引物对及其对应的如SEQ ID NO.40所示的检测探针;或/和,
检测所述区域7的如SEQ ID NO.41和SEQ ID NO.42所示的检测引物对及其对应的如SEQ ID NO.43所示的检测探针;或/和,
检测所述区域8的如SEQ ID NO.44和SEQ ID NO.45所示的检测引物对及其对应的如SEQ ID NO.46所示的检测探针;或/和,
检测所述区域9的如SEQ ID NO.47和SEQ ID NO.48所示的检测引物对及其对应的如SEQ ID NO.49所示的检测探针;或/和,
检测所述区域10的如SEQ ID NO.50和SEQ ID NO.51所示的检测引物对及其对应的如SEQ ID NO.52所示的检测探针;或/和,
检测所述区域11的如SEQ ID NO.53和SEQ ID NO.54所示的检测引物对及其对应的如SEQ ID NO.55所示的检测探针。
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