[发明专利]检测TLX1基因中目标区域的甲基化水平的试剂在制备食管癌诊断产品中的应用

说明书

本发明涉及一种检测TLX1基因的甲基化水平的试剂在制备食管癌诊断产品中的应用。相对于传统技术，本发明具备如下有益效果：发明人在研究食管癌的过程中发现，食管癌变与TLX1基因的甲基化相关，通过检测TLX1基因位于Chr10:101133915‑101135295的区域或者该区域的部分区域的甲基化水平，能够区分食管癌患者、食管良性病变患者和健康人，从而为食管癌的筛查和诊断提供新的技术方案，该技术方案能够实现食管癌的无创或微创筛查和诊断。

技术领域

本发明涉及生物医学领域，具体而言，涉及检测TLX1基因中目标区域的甲基化水平的试剂在制备食管癌诊断产品中的应用。

背景技术

食管癌是起源于食管黏膜上皮的恶性肿瘤，是临床常见的恶性肿瘤之一。食管癌的早期症状并不明显，且多为非持续性的，因而超过90％的食管癌患者在确诊时已进展至中晚期，患者预后差，生活质量低，总体的5年生存率不足20％。而早期食管癌(仅累及黏膜层和黏膜下浅层的病变)通常经内镜下微创治疗即可根治，患者5年生存率超过95％。因此，食管癌的早期发现、早期诊断和早期治疗是降低死亡率和提高生存率的主要策略。

目前，食管内镜及病理活检是诊断食管癌的金标准。但是，由于内镜检查操作难度比较大，对医师的技术水平要求较高，且患者对内镜检查存在一定的畏惧心理，其依从性较差。因此，完善现有的筛查和诊断方法，是实现食管癌诊治的关键步骤。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明实施例的目的包括提供检测TLX1基因位于Chr10:101133915-101135295的区域或者该区域中的部分区域的甲基化水平的试剂在制备食管癌诊断产品中的应用，本发明实施例用TLX1基因中目标区域的甲基化水平的检测试剂制备食管癌诊断试剂盒，采用该试剂盒能够检出食管癌，为食管癌的筛查和诊断提供新的技术方案，该技术方案能够实现食管癌的无创或微创筛查和诊断。

在本发明的第一方面，提供检测TLX1基因中的目标区域的的甲基化水平的试剂在制备食管癌诊断产品中的应用；

以GRCh38.p14为参考基因组，所述目标区域为Chr10:101133915-101135295或者Chr10:101133915-101135295的部分区域。

在本发明的一些实施方式中，所述试剂通过如下方法中的一种或多种实现对所述目标区域的甲基化水平的检测：甲基化特异性PCR、亚硫酸氢盐测序法、甲基化特异性微阵列法、全基因组甲基化测序法、焦磷酸测序法、甲基化特异性高效液相层析法、数字PCR法、甲基化特异性高分辨率溶解曲线法、甲基化敏感性限制性内切酶法和荧光定量法。

在本发明的一些实施方式中，所述试剂包括检测所述目标区域的甲基化水平的检测引物对及其对应的检测探针。

在本发明的一些实施方式中，所述部分区域选自如下定义的区域1至区域11中的一个或者多个：

区域1为Chr10:101133915-101134052，正链，

区域2为Chr10:101134069-101134255，正链，

区域3为Chr10:101134283-101134399，正链，

区域4为Chr10:101134414-101134556，正链，

区域5为Chr10:101134768-101134867，正链，

区域6为Chr10:101134881-101134969，正链，

区域7为Chr10:101135295-101135138，负链，

区域8为Chr10:101134947-101134788，负链，