[发明专利]一种春兰SSR引物组及应用该引物组构建春兰品种指纹图谱的方法

说明书

本发明公开了一种春兰SSR引物组及应用该引物组构建春兰品种指纹图谱的方法。该春兰SSR引物组包括14对SSR引物序列。本发明利用该14对SSR引物序列对春兰基因组DNA进行多重PCR扩增，利用毛细管荧光电泳检测PCR产物，对SSR标记数据进行分析，构建90种春兰SSR指纹图谱，并能够有效的鉴定出春兰品种。本发明构建春兰品种指纹图谱的方法具有高通量、高精度、成本低的优点，应用前景良好。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种春兰SSR引物组及应用该引物组构建春兰品种指纹图谱的方法。

背景技术

春兰(Cymbidium goeringii)，是兰科(Orchidaceae)兰属(Cymbidium)地生种。株型适株型小巧，叶姿优美，花序具单朵花，少有2朵，花型较大，有幽香，是我国传统名贵花卉，在国内外市场深受欢迎。尽管春兰拥有悠久栽培历史和文化传承，但品种鉴定大多取决于传统形态指标，在尚未开花的时候难以通过叶片和株型精准鉴定品种。近年来，随着春兰的推广和市场发展壮大，加之互联网技术的迅速发展，各大电商平台、社交媒体和论坛提供了更加多样化的交易渠道，兰花市场上出现的春兰品种超500种，然而尚无统一规范的品种鉴定标准，产品以次充好，品种混淆的现象普遍存在。为促进适应市场需求的品种选育、鉴定和推广，势必要求建立与之相适应的兰花品种鉴定标准。

兰科植物在全球分布广泛，有801属，超27500种。近年来，分子标记，主要包括RAPD、ISSR、SSR、SRAP和ScoT等广泛用于兰花种内、种间及品种间的分类鉴定、遗传多样性、亲缘关系的分析以及种质资源与种群方面的研究。然而对我国特色资源的鉴定评价受限于地域局限和品种收集难度，目前在国内还未见基于毛细管电泳技术和SSR分子标记对春兰品种进行高通量鉴定的相关报道。因此，开展本发明采用SSR分子标记对春兰品种进行鉴定，将对种质资源鉴评、种质创新利用以及商品花质量监督和市场规范等方面具有重要意义。

发明内容

本发明旨在针对现有技术的技术缺陷，提供一种春兰SSR引物组及利用该引物组、将毛细管电泳技术与SSR-PCR技术结合的构建春兰品种指纹图谱的方法，以快速高效鉴定春兰品种。

本发明的第一个目的是提供一种春兰SSR引物组，其包括以下14对SSR引物序列：

SSR_39969_c0_seq1 F:5’-TCGAACAAGGTCATTTGCCT-3’

R:5’-ACAAGGAGTGAAGGACCTTTT-3’；

SSR_71399_c0_seq1 F:5’-GCATGACTGCCGTTGTGTTT-3’

R:5’-GCAAGTGCATCAAAGCAGATG-3’；

SSR_256535_c0_seq1 F:5’-GGCGGCAGAAATGAACAGAA-3’

R:5’-CCACCCAATATTTTCTCCACCC-3’；

SSR_95792_c0_seq1 F:5’-TGAGGGTGACGCTTTGTTCA-3’

R:5’-TGCAACCAGAGCCAACTGAA-3’；

SSR_26057_c0_seq1 F:5’-AGAAGGTTGTGCGTCGACAT-3’

R:5’-GTTGCTGCAGTTGCGAAGAA-3’；

SSR_56999_c0_seq1 F:5’-TCTCACGCTGCATCCCATTT-3’

R:5’-GTGTTGCTTCCCTTGTTGCA-3’；

SSR_67726_c0_seq1 F:5’-GTGCAGTCGACGGGATCC-3’