[发明专利]肺鳞癌分子分型及生存风险基因群及诊断产品和应用在审
申请号: | 202210949735.3 | 申请日: | 2022-08-09 |
公开(公告)号: | CN115851927A | 公开(公告)日: | 2023-03-28 |
发明(设计)人: | 周彤;胡志元;周伟庆;马琳琳;陆俊欢 | 申请(专利权)人: | 上海善准医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;C12N15/11 |
代理公司: | 北京永新同创知识产权代理有限公司 11376 | 代理人: | 栾星明;程大军 |
地址: | 201499 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺鳞癌 分子 生存 风险 基因 诊断 产品 应用 | ||
1.一组用于确定肺鳞癌分子亚型和/或评估肺鳞癌患者的生存风险的基因群,其包括分子分型及生存风险评估相关基因,其中,所述分子分型及生存风险评估相关基因包括:
(1)以下凝血相关基因中的一个或多个:C4BPA、FGA、HNF1B、SFTA2、SFTA3、SFTPB、CAPN8、CHIA、CLDN18、CRTAC1、FGG、GKN2、HP、ORM1、PLA2G1B、RASGRF1、ROS1和SERPIND1;
(2)以下肽交联相关基因中的一个或多个:SPRR1A、SPRR1B、SPRR2A、SPRR2B、SPRR2D、SPRR2E、A2ML1、CRCT1、IL36B、IL36G、IL36RN、IVL、LCE3E、PGLYRP3、PI3、RAET1L、SBSN、SERPINB13、SPRR2C、SPRR2G、SPRR3、SPRR4、TMPRSS11B、TMPRSS11D和TMPRSS11F;
(3)以下尼古丁代谢相关基因中的一个或多个:DNAJB3、UGT1A1、UGT1A2P、UGT1A6、ADH7、NTRK2和UGT1A4。
2.权利要求1所述的基因群,其包括16个分子分型及生存风险评估相关基因,所述分子分型及生存风险评估相关基因包括:
(1)凝血相关基因:C4BPA、FGA、HNF1B、SFTA2、SFTA3和SFTPB;
(2)肽交联相关基因:SPRR1A、SPRR1B、SPRR2A、SPRR2B、SPRR2D和SPRR2E;
(3)尼古丁代谢相关基因:DNAJB3、UGT1A1、UGT1A2P和UGT1A6。
3.权利要求1所述的基因群,其包括50个分子分型及生存风险评估相关基因,所述分子分型及生存风险评估相关基因包括:
(1)凝血相关基因:C4BPA、FGA、HNF1B、SFTA2、SFTA3、SFTPB、CAPN8、CHIA、CLDN18、CRTAC1、FGG、GKN2、HP、ORM1、PLA2G1B、RASGRF1、ROS1和SERPIND1;
(2)肽交联相关基因:SPRR1A、SPRR1B、SPRR2A、SPRR2B、SPRR2D、SPRR2E、A2ML1、CRCT1、IL36B、IL36G、IL36RN、IVL、LCE3E、PGLYRP3、PI3、RAET1L、SBSN、SERPINB13、SPRR2C、SPRR2G、SPRR3、SPRR4、TMPRSS11B、TMPRSS11D和TMPRSS11F;
(3)尼古丁代谢相关基因:DNAJB3、UGT1A1、UGT1A2P、UGT1A6、ADH7、NTRK2和UGT1A4。
4.权利要求1-3中任一项所述的基因群,其还包括参考基因;
优选地,所述参考基因包括以下中的1个、更优选3个、最优选6个:ACTB、GAPDH、GUSB、TFRC、MRPL19、PSMC4和SF3A1。
5.权利要求2所述的基因群,其还包括参考基因;优选地,所述参考基因包括ACTB、GAPDH、GUSB、TFRC、MRPL19、PSMC4和SF3A1中的三个;更优选地,所述参考基因包括ACTB、GAPDH和GUSB。
6.权利要求3所述的基因群,其还包括参考基因;优选地,所述参考基因包括GAPDH、GUSB、TFRC、MRPL19、PSMC4和SF3A1。
7.用于检测权利要求1-6中任一项所述的基因群中的基因的表达水平的试剂。
8.权利要求7所述的试剂,其为检测所述基因转录的RNA、特别是mRNA的量的试剂;或者,其为检测与mRNA互补的cDNA的量的试剂。
9.权利要求7或8所述的试剂,其为引物、探针或其组合。
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