[发明专利]肺鳞癌分子分型及生存风险基因群及诊断产品和应用

说明书

本发明属于生物技术领域，公开了一组用于肺鳞癌分子分型及生存风险评估的基因群。本发明还公开了检测所述基因群的基因表达水平的试剂在制备产品中的应用，所述产品用于确定肺鳞癌分子亚型及评估肺鳞癌患者的生存风险。所述产品包括二代测序(NGS)检测试剂盒、荧光定量PCR检测试剂盒、基因芯片和蛋白芯片。本发明还公开了利用所述检测试剂盒进行肺鳞癌分子分型及生存风险评估的方法。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及用于对肺鳞癌进行分子分型及评估肺鳞癌患者生存风险的基因群及其体外诊断产品和应用。

背景技术

肺癌是全球范围内常见的恶性肿瘤之一。根据2019年国家癌症中心发布的统计数据，肺癌位居我国恶性肿瘤发病和死亡首位。2015年我国新发肺癌病例约为78.7万例，发病率为57.26/10万，因肺癌死亡人数约为63.1万例，死亡率为45.87/10万。非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer，NSCLC)是肺癌最常见的病理亚型，约占肺癌总数的85％，并可进一步分为腺癌、鳞状细胞癌、大细胞癌等。对于早期非小细胞肺癌(IA-IIA期)以手术治疗为主，多数不进行辅助化疗。然而这些早期非小细胞肺癌术后的5年生存率也仅有49-71％。如何识别这些早期肺癌患者中的高危人群，及早进行术后辅助治疗以提高这部分患者的5年生存率是目前非小细胞肺癌新的研究方向。对于临床晚期失去手术治疗机会的NSCLC患者，传统姑息化疗疗效有限且毒副反应明显，导致患者预后不佳。NSCLC驱动基因的发现及相应分子靶向药物的研发，以及近年推出免疫检查点抑制剂的临床应用，极大地推动了肺癌诊治进入“精准医学”和“个体化诊治”时代。然而，需要指出的是，无论是靶向治疗还是免疫治疗，并非所有患者都可获益。NSCLC中的肺鳞癌(LSC)主要发生于老年男性，与吸烟关系密切，约占NSCLC的30％。与NSCLC中的肺腺癌相比，肺鳞癌通常对常规化疗和放疗相对不敏感，而且因驱动基因较少，有效的靶向治疗方法不多。

近年来，高通量检测技术及分析方法的发展进步为肿瘤研究带来了新的机遇。基于基因表达谱和分子生物学特征为基础提出的肿瘤分子生物学分型及远处转移或生存风险评估，能较好地反映肿瘤的生物学行为，对临床治疗具有潜在指导意义。尽管同属于非小细胞肺癌大类，我们的前期研究发现肺鳞癌的基因表达谱以及与预后密切相关的基因表达改变与肺腺癌有很大差异。临床上有关肺腺癌的分子分型及生存风险评估的研究已有多项报道，而侧重于肺鳞癌的研究尚不多见。

发明内容

在一方面，本发明提供一组用于确定肺鳞癌分子亚型和/或评估肺鳞癌患者的生存风险的基因群，其包括分子分型及生存风险评估相关基因。在一实施方案中，所述基因群还包括参考基因。肺鳞癌的分子亚型包括LSC1亚型、LSC2亚型、LSC3亚型、LSC4亚型、LSC5亚型和混合亚型。

在一方面，本发明还提供用于检测本发明的基因群中的基因的表达水平的试剂。在一优选实施方案中，所述试剂为检测本发明基因转录的RNA、特别是mRNA的量的试剂；或者其为检测与mRNA互补的cDNA的量的试剂。在一具体实施方案中，所述试剂为引物、探针或其组合。

在另一方面，本发明还提供对肺鳞癌进行分子分型和/或生存风险评估的产品，其包含本发明的试剂。本发明还提供本发明的基因群或试剂在制备产品中的应用。所述产品用于确定肺鳞癌分子亚型和/或评估肺鳞癌患者的生存风险。在一实施方案中，所述产品为二代测序试剂盒、实时荧光定量PCR检测试剂盒、基因芯片、蛋白芯片、ELISA诊断试剂盒或免疫组化(IHC)试剂盒。在优选的实施方案中，所述产品为二代测序试剂盒或实时荧光定量PCR检测试剂盒。

在一方面，本发明还提供用于确定受试者的肺鳞癌分子亚型和/或生存风险的方法，所述方法包括：(1)提供受试者的样本；(2)测定所述样本中本发明的基因群中基因的表达水平；(3)确定所述受试者的肺鳞癌分子亚型和/或生存风险。

附图说明

图1示出肺鳞癌分子分型及生存风险评估相关基因在不同中的差异表达。