[发明专利]一种用于鉴定黄精属种质资源的CDDP分子标记引物组及其应用

说明书

本发明属于植物种质资源鉴定技术领域，具体涉及一种用于鉴定黄精属种质资源的CDDP分子标记引物组及其应用。该CDDP分子标记引物组针对WRKY、MYB、ERF、KNOX和MADS设计得到。本发明以WRKY、MYB、ERF、KNOX和MADS五个保守氨基酸序列所对应的保守基因序列为参考序列设计引物，这些短的保守基因序列存在于植物基因组中的多个位置，并提供多个引物结合位点，此种引物设计专注于基因区域，较随机标记有优势。同时，以设计得到的引物对黄精属种质的基因组DNA进行扩增，可以用于黄精属种质资源的鉴定、区分和遗传多样性分析。

技术领域

本发明属于植物种质资源鉴定技术领域，具体涉及一种用于鉴定黄精属种质资源的CDDP分子标记引物组及其应用。

背景技术

黄精属(Polygonatum)是被子植物门百合科下的一个属，该属均为具根状茎草本。该属约有40种，广布于北温带，其中在中国存在有31种。该属的模式物种为：黄精(P.sibiricum.Delar.ex Redout6)。黄精属大多种类的根状茎均可以作药用，为中药玉竹、黄精，前者的功用为养阴润燥、生津止渴，后者的功用为滋润心肺、生津养胃、补精髓。

尽管，本领域普遍知晓黄精是一种具有药用重要性的植物，但是来自不同地区和不同品种的黄精属药用植物被认为在治疗力上有所不同。由于我国黄精属种质资源多样化程度较高，但属下种的区分度不高，没有明确的界限。目前对其遗传多样性和种群结构研究较少，还没充足的数据对其进行鉴别。虽然，RAPD、RFLP、ISSR、SCoT、SSR分子标记技术已应用到黄精种质鉴定、遗传多样性分析和种质资源保护研究中，但尚未以CDDP(conservedDNA-derived polymorphism)分子标记对黄精种质鉴定和遗传多样性进行分析的研究。

CDDP分子标记技术是依据植物中功能基因和基因家族的保守基因序列设计引物，实现快速鉴定不同物种的分子标记手段。目前，CDDP分子标记技术已被应用在部分植物种质资源的鉴定和遗传多样性的研究中，但是还未有用于鉴定和区分黄精属不同植物的CDDP分子标记。因此，急需开发能够区分鉴定黄精属不同种植物的CDDP分子标记。

发明内容

本发明的目的在于提供一种用于鉴定黄精属种质资源的CDDP分子标记引物组及其应用，所述CDDP分子标记引物组可用于黄精属种质资源的鉴定、区分以及遗传多样性的分析。

本发明提供了一种用于鉴定黄精属种质资源的CDDP分子标记引物组，所述CDDP分子标记引物组针对WRKY、MYB、ERF、KNOX和MADS设计得到。

优选的，所述CDDP分子标记引物组包括WRKY-R1、WRKY-R2、WRKY-R3、WRKY-R3B、Myb2、ERF2、KNOX-2、KNOX-3、MADS-1、MADS-2和MADS-4；

所述WRKY-R1、WRKY-R2、WRKY-R3、WRKY-R3B、Myb2、ERF2、KNOX-2、KNOX-3、MADS-1、MADS-2和MADS-4的核苷酸序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.11所示。

本发明提供了一种用于鉴定黄精属种质资源的试剂盒，包括上述技术方案所述的CDDP分子标记引物组。

本发明还提供了上述技术方案所述的CDDP分子标记引物组或试剂盒在黄精属种质鉴定中的应用。

本发明还提供了上述技术方案所述的CDDP分子标记引物组或试剂盒在黄精属遗传多样性分析中的应用。

本发明还提供了上述技术方案所述的CDDP分子标记引物组或试剂盒在黄精属分子育种中的应用。

优选的，所述黄精属包括黄精、多花黄精、滇黄精、湖北黄精和玉竹。

本发明还提供了一种鉴定黄精属种质资源的方法，包括如下步骤：