[发明专利]一种马氏珠母贝抗低温性状相关的SNP分子标记及其应用在审
申请号: | 202210953748.8 | 申请日: | 2022-08-10 |
公开(公告)号: | CN115820871A | 公开(公告)日: | 2023-03-21 |
发明(设计)人: | 王庆恒;赖卓欣;郑哲;杨创业;邓岳文;廖永山 | 申请(专利权)人: | 广东海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 崔玥 |
地址: | 524088 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 种马 珠母 低温 性状 相关 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种马氏珠母贝抗低温性状相关的SNP分子标记,其特征在于,所述分子标记包括SNP351、SNP352、SNP362、SNP365、SNP367、SNP378、SNP396、SNP456、SNP718、SNP823、SNP831中的一种或多种;
其中:所述SNP351位于Perlucin基因第351位,多态性为C或T;
所述SNP352位于Perlucin基因第352位,多态性为G或T;
所述SNP362位于Perlucin基因第362位,多态性为A或G;
所述SNP365位于Perlucin基因第365位,多态性为C或T;
所述SNP367位于Perlucin基因第367位,多态性为A或G;
所述SNP378位于Perlucin基因第378位,多态性为A或T;
所述SNP396位于Perlucin基因第396位,多态性为A或G;
所述SNP456位于Perlucin基因第456位,多态性为A或G;
所述SNP718位于α-Tubulin基因第718位,多态性为G或T;
所述SNP823位于α-Tubulin基因第823位,多态性为A或C;
所述SNP831位于α-Tubulin基因第831位,多态性为A或G。
2.如权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于,所述Perlucin基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
3.如权利要求1所述的SNP分子标记,其特征在于,所述α-Tubulin基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
4.用于扩增如权利要求1所述的SNP分子标记的引物组,其特征在于,所述引物组包括如下位点中的一种或多种:
5.一种试剂盒,其特征在于,包括如权利要求4所述的引物组中的一种或多种。
6.如权利要求1~3任意一项所述的SNP分子标记、或如权利要求4所述的引物组、或权利要求5所述的试剂盒在马氏珠母贝抗低温性状鉴定中的应用,其特征在于,用于鉴定马氏珠母贝抗低温性状位点基因型。
7.一种评估马氏珠母贝抗低温性状的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取待测样品基因组DNA;
(2)以步骤(1)中的基因组DNA为模板,利用如权利要求4所述引物组进行PCR扩增;
(4)将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析或分子测序,获得分子标记的基因型;
(5)根据基因分型结果,判断所述待测样本的抗低温性状。
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