[发明专利]一种马氏珠母贝抗低温性状相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明提供了一种马氏珠母贝抗低温性状相关的SNP分子标记及其应用，属于水产遗传育种技术领域。本发明所述分子标记包括SNP351、SNP352、SNP362、SNP365、SNP367、SNP378、SNP396、SNP456、SNP718、SNP823、SNP831中的一种或多种。本发明所述分子标记可以在苗种繁育前对亲贝进行基因型鉴定，通过筛选具有多个优势基因型的亲贝，提高后代群体的耐低温能力。

技术领域

本发明属于水产遗传育种技术领域，尤其涉及一种马氏珠母贝抗低温性状相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

海洋贝类是一种变温动物，其缺乏体温调节能力，体温与其生存环境的温度相同。因此，环境温度是影响贝类生命活动的最重要的环境因素之一，其变化直接影响贝类的存活、生长代谢、繁殖发育等各个方面，并决定了物种的地理分布。马氏珠母贝(Pinctadafucata martensii)别名合浦珠母贝，隶属于软体动物门双壳纲，在我国主要分布在广东、广西以及海南等南海海域，是典型的暖水性贝类，适温范围15～30℃，最适生长温度为23～28℃，对低温的耐受能力较弱，水温下降到6～8℃超过21h就会大量死亡。因此，培育马氏珠母贝耐低温品系是开展扩展珍珠贝北移养殖，扩展珍珠贝养殖区域的前提。

目前传统的育种方法具有选育周期长、投资大、费时费力等缺点，筛选与抗低温相关的DNA分子标记进行分子辅助育种对于加速抗寒性遗传改良至关重要。经过对现有技术的国内外文献检索，至今未见有Perlucin基因和α-Tubulin基因与马氏珠母贝耐低温相关的研究报告，也没有这两个基因的多态性位点与马氏珠母贝耐低温相关性的报道。

发明内容

有鉴于此，本发明的目的在于提供一种马氏珠母贝抗低温性状相关的SNP分子标记及其应用，该系列分子标记可精准的鉴定出具有抗低温性状的马氏珠母贝。

为了实现上述发明目的，本发明提供了以下技术方案：

本发明提供了一种马氏珠母贝抗低温性状相关的SNP分子标记，所述分子标记包括SNP351、SNP352、SNP362、SNP365、SNP367、SNP378、SNP396、SNP456、SNP718、SNP823、SNP831中的一种或多种；

其中：所述SNP351位于Perlucin基因第351位，多态性为C或T；

所述SNP352位于Perlucin基因第352位，多态性为G或T；

所述SNP362位于Perlucin基因第362位，多态性为A或G；

所述SNP365位于Perlucin基因第365位，多态性为C或T；

所述SNP367位于Perlucin基因第367位，多态性为A或G；

所述SNP378位于Perlucin基因第378位，多态性为A或T；

所述SNP396位于Perlucin基因第396位，多态性为A或G；

所述SNP456位于Perlucin基因第456位，多态性为A或G；

所述SNP718位于α-Tubulin基因第718位，多态性为G或T；

所述SNP823位于α-Tubulin基因第823位，多态性为A或C；

所述SNP831位于α-Tubulin基因第831位，多态性为A或G。

优选的，所述Perlucin基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

优选的，所述α-Tubulin基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

本发明提供用于扩增所述的SNP分子标记的引物组，所述引物组包括如下位点中的一种或多种：