[发明专利]疟原虫和猴D型逆转录病毒的检测试剂、试剂盒及双重PCR检测方法在审

专利信息
申请号: 202210963988.6 申请日: 2022-08-11
公开(公告)号: CN115786583A 公开(公告)日: 2023-03-14
发明(设计)人: 朱婷;杨玲焰;许姗姗;时长军 申请(专利权)人: 苏州西山生物技术有限公司
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 苏州新知行知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32414 代理人: 郑丽玲
地址: 215000 江苏省苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 疟原虫 逆转录 病毒 检测 试剂 试剂盒 双重 pcr 方法
【权利要求书】:

1.一种疟原虫和猴D型逆转录病毒的检测试剂,其特征在于:其包括引物、探针和阳性质控质粒,所述引物包括疟原虫上游引物、疟原虫下游引物、猴D型逆转录病毒上游引物和猴D型逆转录病毒下游引物,疟原虫上游引物、疟原虫下游引物、猴D型逆转录病毒上游引物和猴D型逆转录病毒下游引物的序列分别为SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3和SEQID NO:4;所述探针包括疟原虫探针、猴D型逆转录病毒探针a、猴D型逆转录病毒探针b,疟原虫探针、猴D型逆转录病毒探针a、猴D型逆转录病毒探针b的序列分别为SEQ ID NO:5、SEQID NO:6、SEQ ID NO:7,疟原虫扩增片段长度为199 bp,猴D型逆转录病毒扩增片段长度为122 bp,所述阳性质控质粒的序列为SEQ ID NO:8。

2.一种包含有权利要求1所述的疟原虫和猴D型逆转录病毒的检测试剂的试剂盒。

3.一种疟原虫和猴D型逆转录病毒的双重PCR检测方法,其特征在于:其包括以下步骤:

S1、从全血样本中提取脱氧核糖核酸(DNA);

S2、配制双重荧光定量PCR反应体系,反应体系包括Premix Taq酶、疟原虫上游引物、疟原虫下游引物、猴D型逆转录病毒上游引物、猴D型逆转录病毒下游引物、疟原虫探针、猴D型逆转录病毒探针a、猴D型逆转录病毒探针b、PCR专用水和DNA;

S3、荧光定量PCR反应的反应程序为:在PCR仪中95℃预变性30 s,然后95℃变性5s,60℃退火延伸31s ,在退火延伸时采集信号,并按上述过程进行N次循环;

S4、在整个体系扩增结束后,读取循环数Ct值以及扩增曲线,根据循环数Ct值和扩增曲线来进行检测结果的判断。

4.根据权利要求3所述的疟原虫和猴D型逆转录病毒的双重PCR检测方法,其特征在于:步骤S3的双重荧光定量PCR反应中,在疟原虫和猴D型逆转录病毒基因保守区域设计特异的实时荧光定量PCR引物和探针序列,探针两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团,探针完整时,报告荧光基团发射的荧光信号被淬灭荧光基团吸收,检测不到荧光;在PCR扩增时,Premix Taq酶的5’→3’外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,报告荧光基团释放并发出荧光,荧光能被检测仪器接收,通过荧光信号的强弱对PCR产物进行检测。

5.根据权利要求3所述的检测非人灵长类实验动物全血中疟原虫和猴D型逆转录病毒双重荧光定量PCR方法,其特征在于:步骤S2中PCR扩增采用的阳性质控质粒的制备方法是:以pUC57为载体插入疟原虫和猴D型逆转录病毒特异性保守序列合成的质粒穿刺菌转染到大肠杆菌DH5α中,摇菌增殖后采用质粒提取试剂盒提取纯化质粒,用分光光度计测定浓度,并用无菌TE缓冲液将阳性质控质粒浓度稀释至7.3×109拷贝/μL。

6.根据权利要求3所述的检测非人灵长类实验动物全血中疟原虫和猴D型逆转录病毒双重荧光定量PCR方法,其特征在于:步骤S1中,根据样本的类型,采用全血基因组提取试剂盒提取样本的DNA。

7.根据权利要求3所述的检测非人灵长类实验动物全血中疟原虫和猴D型逆转录病毒双重荧光定量PCR方法,其特征在于:

步骤S4中,猴D型逆转录病毒是否阳性的判断方法为:当FAM通道有扩增曲线,且Ct值≤35,判断猴D型逆转录病毒阳性;当无扩增曲线,且Ct值显示Undet或N/A时,或者有扩增曲线,Ct>38值时,判断猴D型逆转录病毒阴性;当有扩增曲线,35Ct值≤38,建议重复一次实验,复孔检测,若结果相同,则判定35Ct值≤38为猴D型逆转录病毒阳性,35Ct值≤38为猴D型逆转录病毒阳性可疑,建议持续关注该动物,过一段时间后重新采样检测;若无扩增曲线,则判定为猴D型逆转录病毒阴性。

步骤S4中,疟原虫病毒是否阳性的判断方法为:当ROX通道有扩增曲线,且Ct值≤35,判断猴D型逆转录病毒阳性;当无扩增曲线,且Ct值显示Undet或N/A时,或者有扩增曲线,Ct>38值时,判断猴D型逆转录病毒阴性;当有扩增曲线,35Ct值≤38,建议重复一次实验,复孔检测,若结果相同,则判定35Ct值≤38为猴D型逆转录病毒阳性,35Ct值≤38为猴D型逆转录病毒阳性可疑,建议持续关注该动物,过一段时间后重新采样检测;若无扩增曲线,则判定为猴D型逆转录病毒阴性。

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