[发明专利]一种同时检测引起低色素性贫血STEAP3基因突变和eSNP的试剂盒在审
申请号: | 202210984149.2 | 申请日: | 2022-08-17 |
公开(公告)号: | CN116064766A | 公开(公告)日: | 2023-05-05 |
发明(设计)人: | 刘顿;陈创奇;吴远菲;易升;方萍;董云巧;张曦倩;刘风华 | 申请(专利权)人: | 广东省妇幼保健院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11;C12Q1/686 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 姜磊 |
地址: | 510000 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同时 检测 引起 色素 性贫血 steap3 基因突变 esnp 试剂盒 | ||
1.一种同时检测引起低色素性贫血STEAP3基因突变和eSNP的引物组,其特征在于,包括引物对1-7;
所述引物对1的上下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO:1-2所示;所述引物对2的上下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO:3-4所示;所述引物对3的上下游引物核苷酸序列如SEQ IDNO:5-6所示;所述引物对4的上下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO:7-8所示;所述引物对5的上下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO:9-10所示;所述引物对6的上下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO:11-12所示;所述引物对7的上下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO:13-14所示。
2.一种同时检测引起低色素性贫血STEAP3基因突变和eSNP的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的引物组。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括阴性质控品、eSNP(rs6721852)质控品、PCR缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、LC Green染料、甜菜碱、去离子水、DMSO和石蜡油。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述DNA聚合酶为Taq DNA聚合酶。
5.一种非诊断目的的同时检测引起低色素性贫血STEAP3基因突变和eSNP的检测方法,其特征在于,采用权利要求3-4中任一项所述的试剂盒进行检测,包括以下步骤:
(1)采集外周血进行DNA抽提,得到样品DNA;
(2)以所述样品DNA、阴性质控品和eSNP(rs6721852)质控品为模板DNA,分别加入PCR缓冲液、dNTPs、DNA聚合酶、LC Green染料、甜菜碱、去离子水、DMSO、上下游引物对1、2、3、4、5、6或7,得到筛查STEAP3基因突变和eSNP分型的反应体系;
(3)将所述反应体系加入至96孔板中,采用石蜡油进行液封后,进行PCR扩增;
(4)待PCR扩增完成后,在高分辨率熔解曲线分析仪上进行荧光检测,得到HRM分析结果。
6.根据权利要求5的检测方法,其特征在于,步骤(2)中反应体系包括以下组分:PCR缓冲液2.0μL,2.5nM dNTPs 1.0μL,5U/μL Taq DNA聚合酶0.4μL,10μM上下游引物1.2μL,1×LC Green 2.0μL,模板DNA 1.5μL,5M甜菜碱4.0μL,DMSO 2.0μL,去离子水5.9μL。
7.根据权利要求5的检测方法,其特征在于,步骤(3)中扩增反应的反应程序为:95℃预变性5分钟;95℃30秒,62℃30秒,72℃30秒,共45个循环;95℃1分钟,4℃保温。
8.根据权利要求5的检测方法,其特征在于,步骤(4)中荧光检测的条件为:起始温度为55℃,终止温度为98℃,待机温度为42℃。
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