[发明专利]结核病分子标志物组合及其用途在审
申请号: | 202211031891.8 | 申请日: | 2022-08-26 |
公开(公告)号: | CN116068193A | 公开(公告)日: | 2023-05-05 |
发明(设计)人: | 金奇;张笑冰;刘立国 | 申请(专利权)人: | 中国医学科学院病原生物学研究所 |
主分类号: | G01N33/68 | 分类号: | G01N33/68;C12Q1/6883;C12Q1/6851;C07K14/47;C12N15/12;C12N15/11 |
代理公司: | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人: | 刘海罗 |
地址: | 100730*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 结核病 分子 标志 组合 及其 用途 | ||
1.分子标志物组合,包括:
(1)MYL12A蛋白、E1F1蛋白、GBP5蛋白和SRSF5蛋白,或者
(2)编码上述四种蛋白的四种核酸。
2.根据权利要求1所述的分子标志物组合,其为结核病的分子标志物组合。
3.根据权利要求1所述的分子标志物组合,其用于诊断活动性肺结核或结核潜伏感染,或用于区分活动性肺结核和结核潜伏感染。
4.根据权利要求1所述的分子标志物组合,(1)中四种蛋白的氨基酸序列分别如SEQ IDNOs:1-4所示。
5.根据权利要求1所述的分子标志物组合,(2)中所述核酸为DNA或RNA。
6.根据权利要求1所述的分子标志物组合,其中,(2)中所述核酸的序列分别如SEQ IDNOs:5-8所示。
7.权利要求1至6中任一项所述的分子标志物组合或者检测所述分子标志物组合的试剂在制备药物中的用途,所述药物用于诊断活动性肺结核或结核潜伏感染,或用于区分活动性肺结核和结核潜伏感染。
8.根据权利要求7所述的用途,其中,检测所述分子标志物组合的试剂为(1)中四种蛋白的特异性抗体,或者为(2)中所述核酸的特异性引物。
9.根据权利要求7所述的用途,其中,通过qPCR检测(2)中四种核酸的相对表达量。
10.根据权利要求9所述的用途,其中,内参基因采用ACTB、GAPDH或MYO1F作为内参基因,优选地采用MYO1F作为内参基因。
11.根据权利要求7至10中任一权利要求所述的用途,其中,样本为外周血样本、PBMC样本或中性粒细胞样本;优选地,所示中性粒细胞样本为外周血中性粒细胞样本;更优选地,为外周血中性粒细胞提取总RNA后反转录的cDNA样本。
12.根据权利要求7至11中任一权利要求所述的用途,其中,
计算四种核酸各自的相对表达量,并进一步通过样本的四种核酸的组合表达量,判断样本是ATB或LTBI。
13.根据权利要求12所述的用途,其中,按照如下公式计算四种核酸的组合表达量,用STB表示:
其中:
gGBP5指GBP5核酸的表达值,cGBP5指GBP5核酸的阈值,指示GBP5核酸的表达值是否大于阈值,如果表达值大于阈值,则否则
gEIF1指EIF1核酸的表达值,cEIF1指EIF1核酸的阈值,指示EIF1核酸的表达值是否大于阈值,如果表达值大于阈值,则否则
gMYL12A指MYL12A核酸的表达值,cMYL12A指MYL12A核酸的阈值,指示MYL12A核酸的表达值是否大于阈值,如果表达值大于阈值,则否则
gSRSF5指SRSF5核酸的表达值,cSRSF5指SRSF5核酸的阈值,指示SRSF5核酸的表达值是否大于阈值,如果表达值大于阈值,则否则
“max”表示三者求最大,x表示乘法;
当GBP5核酸的表达值大于阈值,且EIF1核酸、MYL12A核酸和SRSF5核酸中至少一个的表达值大于阈值时,STB=1,即诊断为ATB,否则STB=0,即诊断为LTBI。
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