[发明专利]靶向TP53基因的sgRNA及其应用在审
申请号: | 202211070621.8 | 申请日: | 2022-09-02 |
公开(公告)号: | CN115820636A | 公开(公告)日: | 2023-03-21 |
发明(设计)人: | 杨世华;蓝勇丹 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/89;C12N15/85;A01K67/027 |
代理公司: | 广州正明知识产权代理事务所(普通合伙) 44572 | 代理人: | 张丽 |
地址: | 510000 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 靶向 tp53 基因 sgrna 及其 应用 | ||
本发明涉及靶向TP53基因的sgRNA及其应用,属于生物技术领域。本发明提供的靶向敲除TP53基因的sgRNA,其为TP53‑sgRNA 2‑7和TP53‑sgRNA 5‑8。本发明还提供一种食蟹猴TP53基因敲除的方法,该基因敲除方法敲除食蟹猴TP53基因,为建立非人灵长类肿瘤动物模型提供新的有效方法。
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及靶向TP53基因的sgRNA及其应用。
背景技术
TP53基因是一种重要的抑癌基因,其编码的P53蛋白有五个功能域:分别是转录激活功能域(TAD)、富含脯氨酸功能域(PRD)、DNA结合功能域(DBD)、寡聚功能域(TD)、羧基端调控区(CTD)。控制着调控细胞周期、DNA修复和细胞凋亡的基因表达,在维持和保护基因组稳定性有关键作用。TP53基因的缺失或突变与肿瘤有关联,TP53突变影响其蛋白质结构、折叠和稳定性,从而影响其DNA结合能力和生理活性,TP53基因突变导致其肿瘤抑制功能失去或促进肿瘤的发生发展,在人类中约50%的肿瘤中存在TP53基因缺失或者突变,如肝癌、大肠癌、乳腺癌、口咽癌、卵巢癌、前列腺癌、白血病等。同时TP53突变也是人类遗传病李弗梅尼综合征(Li-Fraumeni syndrome,LFS)的发病原因,LFS的特征是发生一系列的早发性癌症,包括肺癌、胰腺癌、白血病等。在肿瘤细胞中约70%TP53的突变为错义突变,错义突变常发生在DNA结合域(DBD)里,DBD里每个密码子都发现TP53突变,但突变主要落在6个突变热点内,分别是氨基酸残基R175、G245、R248、R249、R273和R282,即热点突变主要在第5、7、8外显子上。
因此TP53的基因敲除对肿瘤动物模型的建立有重要意义,TP53基因敲除建立的肿瘤动物模型目前已有许多,其中非人灵长类动物中也有TP53基因敲除的动物模型,本发明主要针对肿瘤中常发生突变的外显子7、8上进行敲除,有可能为非人灵长类动物的各种肿瘤模型提供新的有效方法。
发明内容
为了克服现有技术的不足,本发明的目的在于提供一种靶向敲除TP53基因的sgRNA,其中TP53基因来自食蟹猴。
本发明的另一目的在于提供一种食蟹猴TP53基因敲除的方法,该方法为食蟹猴胚胎上的基因敲除方法,该基因敲除方法敲除食蟹猴TP53基因,进而有可能为制造非人灵长类肿瘤动物模型提供新的有效方法。
本发明通过设计、构建、筛选,最终提供靶向食蟹猴TP53基因的两个高效sgRNA及其靶位点序列,提供一种既可能获得单一位点突变,也可能实现两条sgRNA位点之间大片段的食蟹猴TP53基因敲除的方法,为建立非人灵长类肿瘤模型提供思路。
为实现上述目的,本发明采取的技术方案为:一种靶向敲除TP53基因的sgRNA,其特征在于,所述sgRNA为TP53-sgRNA 2-7和TP53-sgRNA 5-8,其核苷酸序列如下所示:
TP53-sgRNA 2-7:5’-CCGGTTCATGCCGCCCATGC(AGG)-3’;
TP53-sgRNA 5-8:5’-GGCAAGGCTCCCCTTTCTTG(CGG)-3’。
其中,括号内为PAM位点NGG,sgRNA识别位点。
本发明提供所述的靶向敲除TP53基因的sgRNA在TP53基因敲除领域中的应用。
本发明还提供一种食蟹猴TP53基因敲除的方法,包括如下步骤:体外合成所述的靶向敲除TP53基因的sgRNA,与Cas9 mRNA混合注射入食蟹猴胚胎,得到TP53基因敲除的食蟹猴胚胎。
作为本发明所述的食蟹猴TP53基因敲除的方法,其中的一种优选实施方式,所述体外合成靶向敲除TP53基因的sgRNA的具体操作步骤如下:
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