[发明专利]血浆中提取游离DNA的方法在审
申请号: | 202211077828.8 | 申请日: | 2022-09-05 |
公开(公告)号: | CN115478069A | 公开(公告)日: | 2022-12-16 |
发明(设计)人: | 张帆;江赐忠;王和勇 | 申请(专利权)人: | 苏州镒湘医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京达友众邦知识产权代理事务所(普通合伙) 11904 | 代理人: | 陈焕 |
地址: | 215000 江苏省苏州市吴江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 血浆 提取 游离 dna 方法 | ||
本发明涉及生物技术领域,尤其是血浆中提取游离DNA的方法。该方法的具体步骤为,a、取血浆样本置于离心管内,然后在离心管内加入蛋白酶K和裂解液,并将离心管进行涡轮旋转或振荡混合均匀;b、将混合均匀的裂解混合物进行水浴,得到初级混合液;c、将初级混合液与结合液进行混合,再将离心管静置在磁力架上进行磁珠分离,并倒掉离心管内的废液,保留磁珠;d、再在离心管内倒入浓度为75%‑85%的乙醇,并将离心管内的乙醇和磁珠混合;e、用漂洗液对磁珠进行清洗。本发明通过蛋白酶K和裂解液来裂解血浆样本,通过结合液的混合,配合乙醇与漂洗液对磁珠进行清洗,通过洗脱液让磁珠进行磁分离,从而提高了游离DNA的提取纯度。
技术领域
本发明涉及生物技术领域,尤其是血浆中提取游离DNA的方法。
背景技术
游离DNA也叫cell free DNA,一般存在于血浆、血清、胸腹水、脑脊液等样本中,含量较少。血浆是血液除去血细胞和血小板外的液体组分,约占全血体积的50-60%。通过抗凝采血管采集血液,离心后收集到的上层淡黄色液体即为血浆。Mandel等人在1948年首次报道了血浆中游离DNA(cell free DNA,cfDNA)的存在,它是一种胞外DNA,主要是由单链或双链DNA以及单链与双链DNA的混合物组成。健康人和肿瘤患者外周血中均存在cfDNA,而肿瘤患者外周血中cfDNA的含量约为健康人的10倍以上。床研究表明,cfDNA能有效反映患者整体的肿瘤负荷、恶性程度、转移能力以及实时的基因突变信息。现有的游离DNA提取方法有化学法和吸附法,但是现有的提取方法的提取纯度不高。
发明内容
本发明要解决的技术问题是:为了解决背景技术中描述的技术问题,本发明提供了一种血浆中提取游离DNA的方法。通过蛋白酶K和裂解液来裂解血浆样本,通过结合液的混合,配合乙醇与漂洗液对磁珠进行清洗,通过洗脱液让磁珠进行磁分离,从而提高了游离DNA的提取纯度。
本发明解决其技术问题所采用的技术方案是:
一种血浆中提取游离DNA的方法,该方法的具体步骤为:
a、取血浆样本置于离心管内,然后在离心管内加入蛋白酶K和裂解液,并将离心管进行涡轮旋转或振荡混合均匀;
b、将混合均匀的裂解混合物进行水浴,得到初级混合液;
c、将初级混合液与结合液进行混合,再将离心管静置在磁力架上进行磁珠分离,并倒掉离心管内的废液,保留磁珠;
d、再在离心管内倒入浓度为75%-85%的乙醇,并将离心管内的乙醇和磁珠混合;
e、用漂洗液对磁珠进行清洗;
f、将洗脱液放入离心管内,然后将离心管置于磁力架上进行磁分离,最后将离心管内的上清液吸出,上清液即为游离DNA。
具体地,所述裂解液由如下重量份数的组分组成:盐酸胍3-5份、异硫氰酸胍0.8-2.5份、碘化钠1-3份、异丙醇10-20份、水2-5份。
具体地,所述结合液由如下重量份数的组分组成:盐酸胍7-13份、柠檬酸1-3份、异丙醇20-50份、乙酸1-4份、EDTA 5-8份。
具体地,所述漂洗液由如下重量份数的组分组成:异硫氰酸胍5-10份、碘化钠2-6份。
具体地,所述洗脱液由如下重量份数的组分组成:Tris-HCl 5-8份、EDTA1-3份、三羟甲基氨基甲烷6-12份。
具体地,步骤a中,所述血浆样本与裂解液的比例为1:4,所述涡轮旋转的转速为8000-9500rpm。
具体地,步骤b中,所述水浴温度为55-60摄氏度,水浴时间为1-1.2小时。
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