[发明专利]一种产琥珀酸放线杆菌CRISPRi系统构建方法在审
申请号: | 202211080124.6 | 申请日: | 2022-09-05 |
公开(公告)号: | CN115992161A | 公开(公告)日: | 2023-04-21 |
发明(设计)人: | 郑璞;陈春梅;吴丹;陈鹏程 | 申请(专利权)人: | 江南大学 |
主分类号: | C12N15/74 | 分类号: | C12N15/74;C12N15/113;C12N15/54;C12N9/22;C12N1/21;C12P7/46;C12R1/01 |
代理公司: | 哈尔滨市阳光惠远知识产权代理有限公司 23211 | 代理人: | 林娟 |
地址: | 214122 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 琥珀酸 放线 杆菌 crispri 系统 构建 方法 | ||
1.一种CRISPRi系统,其特征在于,所述CRISPRi系统包含质粒pCpf1-CRISPRi,所述质粒pCpf1-CRISPRi包含编码dcpf1的基因和crRNA表达框;所述编码dCpf1的基因位于pckA启动子下游,所述crRNA表达框位于dCpf1基因的下游。
2.根据权利要求1所述的CRISPRi系统,其特征在于,所述crRNA表达框包含frd启动子、crRNA序列和rrnB t1终止子。
3.根据权利要求2所述的CRISPRi系统,其特征在于,所述crRNA表达框的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
4.根据权利要求1所述的CRISPRi系统,其特征在于,所述dCpf1如下(a)~(c):
(a)来源于Francisella tularensis subsp.Novicida;,氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示;
(b)在(a)的基础上,将第917位天冬氨酸突变成丙氨酸;
(c)在(a)的基础上,将第1006位的谷氨酸突变成丙氨酸。
5.权利要求1~4任一所述CRISPRi系统在产琥珀酸放线杆菌基因编辑中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,所述应用为将根据靶基因序列设计的crRNA靶向序列构建至权利要求1~4任一所述CRISPRi系统,转入产琥珀酸放线杆菌,获得基因抑制菌株。
7.根据权利要求5或6所述的应用,其特征在于,所述产琥珀酸放线杆菌包括产琥珀酸放线杆菌ATCC 55618、CGMCC NO.1593、CCTCC NO:M 2012036、CGMCC NO.1716、CCTCCM2011399及其突变株。
8.含有权利要求1~4任一所述CRISPRi系统的微生物细胞。
9.权利要求8所述的微生物细胞在制备含有琥珀酸的产品中的应用。
10.权利要求1~4任一所述CRISPRi系统在研究产琥珀酸放线杆菌特定基因的生物学功能中的应用。
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