[发明专利]一种检测BRCA1基因突变的试剂盒及方法在审
申请号: | 202211089957.9 | 申请日: | 2022-09-07 |
公开(公告)号: | CN115992236A | 公开(公告)日: | 2023-04-21 |
发明(设计)人: | 罗迪贤;文小莎;刘权 | 申请(专利权)人: | 华中科技大学协和深圳医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6806;C12N15/11 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 赵颖 |
地址: | 518000 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 brca1 基因突变 试剂盒 方法 | ||
1.一种检测BRCA1基因突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括正义引物、反义引物和耐高温限制性内切酶;
所述正义引物和反义引物为分别结合BRCA1基因c.981_982区的上游和下游的引物;
所述耐高温限制性内切酶切割BRCA1基因c.981_982区野生型片段。
2.根据权利要求1所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒,其特征在于,所述正义引物的核酸序列包括SEQ ID NO.1所示的序列;
优选地,所述反义引物的核酸序列包括SEQ ID NO.2所示的序列。
3.根据权利要求1或2所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒,其特征在于,所述耐高温限制性内切酶包括FatⅠ内切酶。
4.根据权利要求1-3任一项所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR反应液;
优选地,所述PCR反应液包括DNA聚合酶、dNTP、PCR反应缓冲液和水;
优选地,所述DNA聚合酶包括高保真DNA聚合酶。
5.一种富集BRCA1基因突变区片段的方法,其特征在于,所述方法包括:
取待测样本DNA作为模板,利用权利要求1-4任一项所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒中正义引物和反义引物进行PCR扩增,在PCR扩增产物中加入耐高温限制性内切酶,进行酶切反应,利用酶切反应产物继续进行PCR扩增。
6.根据权利要求5所述的富集BRCA1基因突变区片段的方法,其特征在于,所述PCR扩增的条件为:
93~98℃预变性3~8min;
93~98℃变性25~35sec,50~55℃退火25~35sec;
70~75℃延伸25~35sec,10~20个循环;
优选地,所述酶切反应的条件为50~60℃反应0.5~2h。
7.一种以非疾病诊断的检测BRCA1基因突变的方法,其特征在于,所述方法包括:
以权利要求5或6所述的富集BRCA1基因突变区片段的方法富集待测样本中BRCA1基因突变区片段,对富集产物进行测序,根据测序结果进行对比分析,判断待测样本是否存在突变。
8.根据权利要求7所述的以非疾病诊断的检测BRCA1基因突变的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
(1)取待测样本DNA作为模板,利用权利要求1-4任一项所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒中正义引物和反义引物进行PCR扩增,93~98℃预变性3~8min;93~98℃变性25~35sec,50~55℃退火25~35sec;70~75℃延伸25~35sec,10~20个循环;
(2)向步骤(1)PCR扩增产物中加入耐高温限制性内切酶,50~60℃反应0.5~2h;
(3)利用步骤(2)酶切反应产物继续进行PCR扩增,93~98℃预变性3~8min;93~98℃变性25~35sec,50~55℃退火25~35sec;70~75℃延伸25~35sec,10~20个循环;
(4)对步骤(3)扩增产物进行测序,根据测序结果进行对比分析,判断待测样本是否存在突变。
9.一种检测BRCA1基因突变的装置,其特征在于,所述装置包括富集单元和测序分析单元;
所述富集单元用于执行权利要求5或6所述的富集BRCA1基因突变区片段的方法;
所述测序分析单元用于执行包括:
对富集单元的富集产物进行测序,根据测序结果进行对比分析,判断待测样本是否存在突变。
10.根据权利要求9所述的检测BRCA1基因突变的装置,其特征在于,所述富集单元用于执行包括以下步骤:
(1)取待测样本DNA作为模板,利用权利要求1-4任一项所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒中正义引物和反义引物进行PCR扩增,93~98℃预变性3~8min;93~98℃变性25~35sec,50~55℃退火25~35sec;70~75℃延伸25~35sec,10~20个循环;
(2)向步骤(1)PCR扩增产物中加入耐高温限制性内切酶,50~60℃反应0.5~2h;
(3)利用步骤(2)酶切反应产物继续进行PCR扩增,93~98℃预变性3~8min;93~98℃变性25~35sec,50~55℃退火25~35sec;70~75℃延伸25~35sec,10~20个循环;
所述测序分析单元用于执行包括:
对富集单元的富集产物进行测序,根据测序结果进行对比分析,判断待测样本是否存在突变。
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