[发明专利]一种检测BRCA1基因突变的试剂盒及方法在审

专利信息
申请号: 202211089957.9 申请日: 2022-09-07
公开(公告)号: CN115992236A 公开(公告)日: 2023-04-21
发明(设计)人: 罗迪贤;文小莎;刘权 申请(专利权)人: 华中科技大学协和深圳医院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6806;C12N15/11
代理公司: 北京品源专利代理有限公司 11332 代理人: 赵颖
地址: 518000 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 brca1 基因突变 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种检测BRCA1基因突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括正义引物、反义引物和耐高温限制性内切酶;

所述正义引物和反义引物为分别结合BRCA1基因c.981_982区的上游和下游的引物;

所述耐高温限制性内切酶切割BRCA1基因c.981_982区野生型片段。

2.根据权利要求1所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒,其特征在于,所述正义引物的核酸序列包括SEQ ID NO.1所示的序列;

优选地,所述反义引物的核酸序列包括SEQ ID NO.2所示的序列。

3.根据权利要求1或2所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒,其特征在于,所述耐高温限制性内切酶包括FatⅠ内切酶。

4.根据权利要求1-3任一项所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR反应液;

优选地,所述PCR反应液包括DNA聚合酶、dNTP、PCR反应缓冲液和水;

优选地,所述DNA聚合酶包括高保真DNA聚合酶。

5.一种富集BRCA1基因突变区片段的方法,其特征在于,所述方法包括:

取待测样本DNA作为模板,利用权利要求1-4任一项所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒中正义引物和反义引物进行PCR扩增,在PCR扩增产物中加入耐高温限制性内切酶,进行酶切反应,利用酶切反应产物继续进行PCR扩增。

6.根据权利要求5所述的富集BRCA1基因突变区片段的方法,其特征在于,所述PCR扩增的条件为:

93~98℃预变性3~8min;

93~98℃变性25~35sec,50~55℃退火25~35sec;

70~75℃延伸25~35sec,10~20个循环;

优选地,所述酶切反应的条件为50~60℃反应0.5~2h。

7.一种以非疾病诊断的检测BRCA1基因突变的方法,其特征在于,所述方法包括:

以权利要求5或6所述的富集BRCA1基因突变区片段的方法富集待测样本中BRCA1基因突变区片段,对富集产物进行测序,根据测序结果进行对比分析,判断待测样本是否存在突变。

8.根据权利要求7所述的以非疾病诊断的检测BRCA1基因突变的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:

(1)取待测样本DNA作为模板,利用权利要求1-4任一项所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒中正义引物和反义引物进行PCR扩增,93~98℃预变性3~8min;93~98℃变性25~35sec,50~55℃退火25~35sec;70~75℃延伸25~35sec,10~20个循环;

(2)向步骤(1)PCR扩增产物中加入耐高温限制性内切酶,50~60℃反应0.5~2h;

(3)利用步骤(2)酶切反应产物继续进行PCR扩增,93~98℃预变性3~8min;93~98℃变性25~35sec,50~55℃退火25~35sec;70~75℃延伸25~35sec,10~20个循环;

(4)对步骤(3)扩增产物进行测序,根据测序结果进行对比分析,判断待测样本是否存在突变。

9.一种检测BRCA1基因突变的装置,其特征在于,所述装置包括富集单元和测序分析单元;

所述富集单元用于执行权利要求5或6所述的富集BRCA1基因突变区片段的方法;

所述测序分析单元用于执行包括:

对富集单元的富集产物进行测序,根据测序结果进行对比分析,判断待测样本是否存在突变。

10.根据权利要求9所述的检测BRCA1基因突变的装置,其特征在于,所述富集单元用于执行包括以下步骤:

(1)取待测样本DNA作为模板,利用权利要求1-4任一项所述的检测BRCA1基因突变的试剂盒中正义引物和反义引物进行PCR扩增,93~98℃预变性3~8min;93~98℃变性25~35sec,50~55℃退火25~35sec;70~75℃延伸25~35sec,10~20个循环;

(2)向步骤(1)PCR扩增产物中加入耐高温限制性内切酶,50~60℃反应0.5~2h;

(3)利用步骤(2)酶切反应产物继续进行PCR扩增,93~98℃预变性3~8min;93~98℃变性25~35sec,50~55℃退火25~35sec;70~75℃延伸25~35sec,10~20个循环;

所述测序分析单元用于执行包括:

对富集单元的富集产物进行测序,根据测序结果进行对比分析,判断待测样本是否存在突变。

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