[发明专利]用于预测肿瘤进展及预后的基因标志物组合、试剂盒及系统有效
申请号: | 202211094688.5 | 申请日: | 2022-09-03 |
公开(公告)号: | CN115747329B | 公开(公告)日: | 2023-10-17 |
发明(设计)人: | 吴玲祥;吴维 | 申请(专利权)人: | 昂凯生命科技(苏州)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G16B20/30;G16B25/10;G16B25/20;G16H10/60 |
代理公司: | 杭州信与义专利代理有限公司 33450 | 代理人: | 万景旺 |
地址: | 215004 江苏省苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 预测 肿瘤 进展 预后 基因 标志 组合 试剂盒 系统 | ||
1.一种基因标志物组合,其特征在于,所述基因标志物组合包括S100A10、FOSL2、SPP1、CAV1、ANXA1、VIM、CD44、SERPINH1、LGALS3、CEBPB、ATF5和LGALS1中的至少一个基因。
2.根据权利要求1所述的基因标志物组合,其特征在于,所述基因标志物组合包括S100A10、FOSL2、SPP1、CAV1、ANXA1、VIM、CD44、SERPINH1、LGALS3、CEBPB、ATF5和LGALS1。
3.权利要求1所述的基因标志物组合的表达水平检测试剂在制备用于预测肿瘤进展和/或预后的试剂盒中的应用。
4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述基因标志物组合的表达水平检测试剂为引物和/或探针。
5.一种预测肿瘤进展和/或预后的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的基因标志物组合的表达水平检测试剂。
6.一种预测肿瘤进展和/或预后的系统,其特征在于,包括:
数据输入模块,用于获得权利要求1所述基因标志物组合中各基因的表达水平;
预测模块,与所述数据输入模块连接,用于根据所述各基因的表达水平,利用单样本基因集富集分析方法预测肿瘤进展和/预后。
7.根据权利要求6所述的系统,其特征在于,所述预测模块中,利用单样本基因集富集分析方法获得所述基因标志物组合的富集分数,富集分数越高,肿瘤进展越晚期,预后越差。
8.根据权利要求6所述的系统,其特征在于,所述各基因的表达水平是基于RNA样本通过选自包括转录组测序、捕获测序和qRT-PCR的组中的至少一种方法获得的。
9.根据权利要求6所述的系统,其特征在于,还包括参数存储模块,与所述预测模块连接,用于存储所述富集分数参考值,所述富集分数参考值是利用群体样本得到的。
10.根据权利要求9所述的系统,其特征在于,所述参数存储模块中的富集分数参考值根据所述预测模块中的预测结果进行更新。
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