[发明专利]评估胃癌和或结直肠癌对5-氟尿嘧啶耐药性的探针引物组及其试剂盒在审

专利信息
申请号: 202211190723.3 申请日: 2022-09-28
公开(公告)号: CN116377060A 公开(公告)日: 2023-07-04
发明(设计)人: 赵丽瑛;马强 申请(专利权)人: 南方医科大学
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6851;C12N15/11;G16B40/20;G16B25/20
代理公司: 广州市智远创达专利代理有限公司 44619 代理人: 王会龙
地址: 510000 广东省广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 评估 胃癌 直肠癌 嘧啶 耐药性 探针 引物 及其 试剂盒
【权利要求书】:

1.一种评估胃癌和/或结直肠癌对5-氟尿嘧啶耐药性的探针引物组,其特征在于,所述探针引物组包括:分别检测Col10a1基因、DDR1基因或DDR2基因中一个或几个的探针和上下游引物的组合;

所述Col10a1基因在GenBank上的登录号为XM_011535432.4,所述检测Col10a1基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示,所述扩增Col10a1基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示;

所述DDR1基因在GenBank上的登录号为NM_001202521.1,所述检测DDR1基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:10所示,所述扩增DDR1基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:3和SEQ ID NO:4所示;

所述DDR2基因在GenBank上的登录号为NM_001014796.3,所述检测DDR2基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:11所示,所述扩增DDR2基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:5和SEQ ID NO:6所示。

2.根据权利要求1所述的探针引物组,其特征在于,所述探针引物组包括:权利要求1中所述检测Col10a1基因、DDR1基因和DDR2基因的探针和上下游引物的组合。

3.根据权利要求1所述的探针引物组,其特征在于,所述探针引物组还含有扩增ACTB基因的探针和引物组,所述ACTB基因在GenBank上的登录号为NM_001101.5,所述检测ACTB基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:12所示,所述扩增ACTB基因的引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示。

4.根据权利要求1到3任一所述的探针引物组,其特征在于,所述探针3’端标记有淬灭基团,所述探针5’端标记有荧光基团。

5.权利要求1到4任一所述探针引物组在制备评估胃癌和/或结直肠癌对5-氟尿嘧啶耐药性的试剂盒。

6.检测Col10a1基因、DDR1基因和/或DDR2基因的试剂在制备评估胃癌和/或结直肠癌对5-氟尿嘧啶耐药性的试剂盒中的应用,其特征在于,所述Col10a1基因在GenBank上的登录号为XM_011535432.4,所述DDR1基因在GenBank上的登录号为NM_001202521.1,所述DDR2基因在GenBank上的登录号为NM_001014796.3。

7.一种评估胃癌和/或结直肠癌对5-氟尿嘧啶耐药性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中含有检测Col10a1基因、DDR1基因和/或DDR2基因的试剂。

8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中含有检测Col10a1基因、DDR1基因和DDR2基因的试剂。

9.根据权利要求7或8所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂为探针引物组:所述Col10a1基因在GenBank上的登录号为XM_011535432.4,所述检测Col10a1基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示,所述扩增Col10a1基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:1和SEQ ID NO:2所示;

所述DDR1基因在GenBank上的登录号为NM_001202521.1,所述检测DDR1基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:10所示,所述扩增DDR1基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:3和SEQ ID NO:4所示;

所述DDR2基因在GenBank上的登录号为NM_001014796.3,所述检测DDR2基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:11所示,所述扩增DDR2基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ IDNO:5和SEQ ID NO:6所示。

10.根据权利要求9所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还含有扩增ACTB基因的探针和引物组,所述ACTB基因在GenBank上的登录号为NM_001101.5,所述检测ACTB基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:12所示,所述扩增ACTB基因的引物组的核苷酸序列如SEQID NO:7和SEQ ID NO:8所示。

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