[发明专利]评估胃癌和或结直肠癌对5-氟尿嘧啶耐药性的探针引物组及其试剂盒在审
申请号: | 202211190723.3 | 申请日: | 2022-09-28 |
公开(公告)号: | CN116377060A | 公开(公告)日: | 2023-07-04 |
发明(设计)人: | 赵丽瑛;马强 | 申请(专利权)人: | 南方医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6851;C12N15/11;G16B40/20;G16B25/20 |
代理公司: | 广州市智远创达专利代理有限公司 44619 | 代理人: | 王会龙 |
地址: | 510000 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 评估 胃癌 直肠癌 嘧啶 耐药性 探针 引物 及其 试剂盒 | ||
本发明公开了一种评估胃癌和/或结直肠癌对5‑氟尿嘧啶耐药性的探针引物组及其试剂盒。所述试剂盒含有检测col10a1、DDR1、DDR2和ACTB基因的引物组和探针,以ACTB基因为内参基因,用荧光PCR检测待测样本col10a1基因、DDR1基因和DDR2基因mRNA的表达情况,建立综合评定模型,确定Col10a1、DDR1和DDR2基因的回归系数,采用综合评估值‑0.85作为阳性判断值,判断患者是否适用于5‑氟尿嘧啶药物治疗。本试剂盒特异性强,灵敏度高,操作简便,检测时间短,可实现高通量检测,且价格低廉。
技术领域
本发明涉及分子检测技术领域,具体涉及一种评估胃癌和或结直肠癌对5-氟尿嘧啶耐药性的探针引物组及其试剂盒。
背景技术
胃癌和结直肠癌是全球发病率较高且常见的消化道恶性肿瘤,其发病率与病死率均保持逐年上升的趋势。目前我国的胃癌和结直肠癌呈现较高的发病风险和死亡风险的特点,由于缺乏大规模筛查,而我国的胃癌及结直肠癌的早诊率比较低,许多患者发现即被诊断为晚期。而对于晚期胃癌及结直肠癌患者多数已错过最佳治疗时期,尽管目前已有手术、放化疗、生物靶向治疗等多种治疗方法,但其5年生存率仍很低。
5-氟尿嘧啶(5-FU)属于抗代谢类药物,不但可以通过细胞内酶作用影响DNA的复制,也可转化为氟尿嘧啶核苷掺入细胞RNA,干扰蛋白质的合成,从而发挥细胞毒作用,抑制肿瘤细胞功能,常被作为胃癌和结直肠癌治疗的标准一线药物,但近年来其易引起化疗耐药甚至多重耐药性严重影响了胃癌和结直肠肠癌化疗疗效。
化疗耐药主要由药物滥用、肿瘤细胞基因表达异质性和不稳定性等原因导致,可引发肿瘤化疗失败及肿瘤复发,相较于不断升级化疗方案,寻找合适的用药途径并制定个性化的治疗方案具有重要的临床意义。目前有较多基因和蛋白在胃癌组织和结直肠癌组织中异常表达,但并非每个基因都与化疗耐药耐药相关,也并不清楚哪一种基因能克服5-FU耐药,从而治疗胃癌和结直肠癌。
发明内容
有鉴于此,为了克服现有技术中的不足之处,本发明的所解决的技术问题在于提供一种评估胃癌和或结直肠癌对5-氟尿嘧啶耐药性的探针引物组及其试剂盒。
为了实现上述目的,本发明是通过以下方案予以实现的:
一种评估胃癌和或结直肠癌对5-氟尿嘧啶耐药性的探针引物组,所述探针引物组包括:分别检测Col10a1基因、DDR1基因或DDR2基因中一个或几个的探针和上下游引物的组合;
所述Col10a1基因在GenBank上的登录号为XM_011535432.4,所述检测Col10a1基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:9所示,所述扩增Col10a1基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示;
所述DDR1基因在GenBank上的登录号为NM_001202521.1,所述检测DDR1基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:10所示,所述扩增DDR1基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示;
所述DDR2基因在GenBank上的登录号为NM_001014796.3,所述检测DDR2基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:11所示,所述扩增DDR2基因的上下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6所示。
优选地,所述探针引物组包括:所述检测Col10a1基因、DDR1基因和DDR2基因的探针和上下游引物的组合。
优选地,所述探针引物组还含有扩增ACTB基因的探针和引物组,所述ACTB基因在GenBank上的登录号为NM_001101.5,所述检测ACTB基因的探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:12所示,所述扩增ACTB基因的引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8所示。
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