[发明专利]肉瘤预后制剂、基因组合标志物及其检测试剂的应用在审
申请号: | 202211290220.3 | 申请日: | 2022-10-21 |
公开(公告)号: | CN115612741A | 公开(公告)日: | 2023-01-17 |
发明(设计)人: | 杨眉;黎志宏;王嘉杰 | 申请(专利权)人: | 中南大学湘雅二医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;G16B30/00;G16B40/00;G16B25/10;G16B50/30 |
代理公司: | 长沙市融智专利事务所(普通合伙) 43114 | 代理人: | 袁靖 |
地址: | 410011 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肉瘤 预后 制剂 基因 组合 标志 及其 检测 试剂 应用 | ||
1.用于肉瘤预后的基因组合标志物,其特征在于,包括:
SRPK1、DHRS12、TARDBP、LRRC1、HNMT、DCAF13、ALDH1A1、NETO2、CHD7、SLC19A1、GREM2、CCDC69、HMGN1、DPF3中的至少一个。
2.权利要求1所述的基因组合标志物的检测试剂在制备肉瘤预后制剂中的应用,其特征在于,所述的基因组合标志物包括:
SRPK1、DHRS12、TARDBP、LRRC1、HNMT、DCAF13、ALDH1A1、NETO2、CHD7、SLC19A1、GREM2、CCDC69、HMGN1、DPF3中的至少一个。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,将基因标志物的表达量归一化处理后的FPKM值代入模型公式,计算每个样本的风险评分;
其中,所述模型公式为RS=(2.528×FPKM SRPK1)+(-21.670×FPKM DHRS12)+(8.429×FPKM TARDBP)+(12.166×FPKM LRRC1)+(-2.991×FPKM HNMT)+(3.846×FPKM DCAF13)+(-5.367×FPKM ALDH1A1)+(10.015×FPKM NETO2)+(2.433×FPKM CHD7)+(4.264×FPKMSLC19A1)+(-3.433×FPKM GREM2)+(-0.670×FPKM CCDC69)+(13.340×FPKM HMGN1)+(2.412×FPKM DPF3);
将纳入模型的基因代入公式为每个样本计算风险评分,按各队列风险评分中位数进行分组。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,当RS≤69.501时,将样本划分为低危组,当RS69.501时,将样本划分为高危组。
5.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述检测试剂为二代测序技术。
6.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述检测试剂针对的待测样本选自原发性肉瘤组织和/或细胞。
7.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述肉瘤包括:尤文肉瘤、平滑肌软组织肉瘤、骨肉瘤、脂肪肉瘤、纤维肉瘤、肌肉瘤、神经鞘瘤、滑膜肉瘤。
8.一种肉瘤预后制剂,其特征在于,包括权利要求2-7任一项中所述的检测试剂。
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