[发明专利]一种菌藻共生球总RNA的提取方法在审
申请号: | 202211336175.0 | 申请日: | 2022-10-28 |
公开(公告)号: | CN115873843A | 公开(公告)日: | 2023-03-31 |
发明(设计)人: | 申丽;王俊俊;田庆华;曾伟民;成金菊;周豪 | 申请(专利权)人: | 中南大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 南京普睿益思知识产权代理事务所(普通合伙) 32475 | 代理人: | 曹花 |
地址: | 410000 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 共生 rna 提取 方法 | ||
1.一种菌藻共生球总RNA的提取方法,其特征在于,包括以下步骤:将菌藻共生球置于无菌预冷研钵中,加入菌藻共生球质量的1~3倍的石英砂和液氮(使菌藻共生球全部浸没在液氮中)后,迅速充分研磨得到细胞匀浆,离心后收集细胞匀浆上清液,用于后续总RNA提取;所述菌藻共生球为霉菌与微藻共生培养形成。
2.如权利要求1所述菌藻共生球总RNA的提取方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)细胞匀浆处理:将菌藻共生球置于无菌预冷研钵中,加入菌藻共生球质量的1~3倍的石英砂和液氮(使菌藻共生球全部浸没在液氮中)后,迅速充分研磨得到细胞匀浆,离心后收集细胞匀浆上清液,备用;
2)将步骤1)得到的细胞匀浆上清液转入离心管,按每5~10×106个细胞加入1mL RNAisolater,静置5~10min;待样品完全融化后,再继续吹打至裂解液透明;
3)将裂解液转移至离心管中,离心,吸取裂解液上清;
4)向步骤3)的裂解液上清中加入500~700μl的氯仿/异戊醇,涡旋混合后,4℃静置10min以上,离心,去除上清液,
5)加入至少1mL 75%乙醇洗涤步骤4)离心后的沉淀,并上下颠倒混匀,室温静置3-5min后,离心,弃去上清;
6)在洁净的环境中室温敞口干燥沉淀2-5min,加入适量的RNase-free ddH2O溶解沉淀,即可得到总RNA。
3.如权利要求1所述菌藻共生球总RNA的提取方法,其特征在于,所述菌藻共生球为霉菌与集胞藻、聚球藻、小球藻、蓝丝菌任一一种微藻共生培养形成的菌藻共生球。
4.如权利要求3所述菌藻共生球总RNA的提取方法,其特征在于,所述菌藻共生球为烟曲霉或青霉与集胞藻Synechcystis sp.PCC6803共生培养形成的菌藻共生球。
5.如权利要求4所述菌藻共生球总RNA的提取方法,其特征在于,步骤1)中,烟曲霉(Aspergillusfumigatus),为实验室分离筛选得到的烟曲霉,筛选样本源自广东省阳江市阳东区东平镇柳溪重金属废水水样,其核苷酸序列如SEQ NO.1所示。
6.如权利要求1~5任一项所述菌藻共生球总RNA的提取方法,其特征在于,步骤1)中,所述菌藻共生球的直径为0.2~0.3cm,单次研磨的菌藻共生球的数量为6~8个。
7.如权利要求2所述的菌藻共生球总RNA的提取方法,其特征在于,所述石英砂的用量为菌藻共生球的1~1.5倍,单次研磨石英砂的用量为0.05~0.1g。
8.如权利要求2所述的菌藻共生球总RNA的提取方法,其特征在于,步骤4)中,所述氯仿/异戊醇体积比例为24:1。
9.如权利要求2所述的菌藻共生球总RNA的提取方法,其特征在于,步骤5)中,所述75%乙醇采用RNase-free ddH2O配制。
10.如权利要求2所述的菌藻共生球总RNA的提取方法,其特征在于,步骤6)中,RNase-free ddH2O的用量为30μL。
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