[发明专利]一种基于ERA技术的急性肝胰腺坏死病病原的检测方法及应用在审
申请号: | 202211341770.3 | 申请日: | 2022-11-02 |
公开(公告)号: | CN115948582A | 公开(公告)日: | 2023-04-11 |
发明(设计)人: | 王孟强;周清倩;胡景杰;包振民;王燕;刘可欣;邵烁如 | 申请(专利权)人: | 中国海洋大学三亚海洋研究院;中国海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/63 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 王美燕 |
地址: | 572024 海南省三亚市崖州区*** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 era 技术 急性 胰腺 坏死 病原 检测 方法 应用 | ||
1.一种基于ERA技术的急性肝胰腺坏死病病原的检测方法,其特征在:包括如下步骤:
步骤1:设计并筛选检测虾急性肝胰腺坏死病的引物组和特异性荧光探针:
选取急性肝胰腺坏死病致病质粒中,长度1665bp的pirAB序列作为检测靶基因,设计RT-ERA引物组和RT-ERA荧光型探针;
步骤2:RT-ERA检测:以待测样品的基因组DNA为模板,采用步骤1)设计的RT-ERA引物组和探针,在33℃-42℃下进行恒温RT-ERA扩增,得到RT-ERA扩增产物,检测其荧光信号强度,根据15min内的扩增曲线的荧光信号值,判断扩增结果。
2.如权利要求1所述的一种基于ERA技术的急性肝胰腺坏死病病原的检测方法,其特征在于:所述RT-ERA引物组的上下游引物的序列长度各为28-35个核苷酸,GC含量在40%-60%之间。
3.如权利要求2所述的一种基于ERA技术的急性肝胰腺坏死病病原的检测方法,其特征在于:所述RT-ERA引物组的核苷酸序列如SEQ ID NO:1-2所示。
4.如权利要求1所述的一种基于ERA技术的急性肝胰腺坏死病病原的检测方法,其特征在于:所述RT-ERA荧光型探针的序列长度为46-52个核甘酸,RT-ERA荧光型探针序列中,含有THF残基、dT-荧光团和dT-淬灭团取代靶标扩增子序列内的碱基。
5.如权利要求4所述的一种基于ERA技术的急性肝胰腺坏死病病原的检测方法,其特征在于:所述RT-ERA荧光型探针的核苷酸序列如SEQ ID NO:3-4所示。
6.如权利要求1所述的一种基于ERA技术的急性肝胰腺坏死病病原的检测方法,其特征在于:所述RT-ERA检测方法,具体步骤如下:
(1)RT-ERA扩增:配制RT-ERA反应管:取溶解剂、RT-ERA引物组、RT-ERA荧光型探针、模板和ddH20;加入含ERA反应试剂的RT-ERA反应管中,震荡混匀,并在每个反应管盖上加入激活剂,离心混匀后迅速将反应管置于便携式荧光扩增检测仪器中,33℃-42℃下进行恒温RT-ERA扩增反应,得到RT-ERA扩增产物;
(2)荧光信号检测:若在RT-ERA扩增的15min内扩增曲线的荧光信号值超过阈值且出现拐点,则表明扩增结果为感染或候选感染ANPND;若RT-ERA扩增产物不满足上述条件,则表明扩增结果显示为未感染或候选未感染AHPND。
7.如权利要求6所述的一种基于ERA技术的急性肝胰腺坏死病病原的检测方法,其特征在于:所述RT-ERA反应管中,包括20μL溶解剂、浓度为10μM的RT-ERA引物组2μL、浓度为10μM的探针0.6μL、2μL模板和21.4μL ddH20;激活剂用量为2μL。
8.一种如权利要求1-3中任意一项所述的基于ERA技术的急性肝胰腺坏死病病原的检测方法,在对虾急性肝胰腺坏死病的预防和控制中的应用。
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