[发明专利]用于检测西瓜橙/黄瓤色性状的KASP标记引物组合及其应用在审
申请号: | 202211357434.8 | 申请日: | 2022-11-01 |
公开(公告)号: | CN116179744A | 公开(公告)日: | 2023-05-30 |
发明(设计)人: | 王昌盛;王海艳;刘金宝;金炳奎;曹亚婕;由守昌;杨猛 | 申请(专利权)人: | 优奈尔生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 山东济南齐鲁科技专利事务所有限公司 37108 | 代理人: | 张德平 |
地址: | 261100 山东省潍坊*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 西瓜 黄瓤色 性状 kasp 标记 引物 组合 及其 应用 | ||
1.用于检测西瓜橙/黄瓤色性状的KASP标记引物组合,其特征在于:所述西瓜橙/黄瓤色的性状控制基因为OYC基因,所述KASP标记引物组合包括如下三条引物:
上游引物1的核心序列:
5'-ggtgaagtttgtgcagagtatgcca-3';
上游引物2的核心序列:
5'-ggtgaagtttgtgcagagtatgccg-3';
下游引物的序列:
5'-cttcaattttccatctccaaacacatgtc-3'。
2.根据权利要求1所述的用于检测西瓜橙/黄瓤色性状的KASP标记引物组合,其特征在于:所述KASP标记引物组合包括如下三条引物:
上游引物F1的序列:
5'-gaaggtgaccaagttcatgctggtgaagtttgtgcagagtatgcca-3';
上游引物F2的序列:
5'-gaaggtcggagtcaacggattggtgaagtttgtgcagagtatgccg-3';
下游引物的序列:
5'-cttcaattttccatctccaaacacatgtc-3'。
3.用于检测西瓜橙/黄瓤色性状的KASP标记引物组合的应用,其特征在于:所述应用为用于检测西瓜的橙或黄瓤色性状,包括以下步骤:
(1)提取待测西瓜品种基因组DNA;
(2)使用含有检测西瓜橙/黄瓤色性状的KASP标记引物组合对西瓜基因组DNA进行PCR扩增;
(3)根据PCR荧光信号的差异,利用软件进行分析,进而鉴别出每个待测西瓜的基因型,即鉴定出属于纯合AA、GG,杂合AG基因型的西瓜品种。
4.根据权利要求3所述的用于检测西瓜橙/黄瓤色性状的KASP标记引物组合的应用,其特征在于:
所述PCR扩增:采用的PCR反应体系为:20-100ng/μL西瓜基因组DNA 2.5μL,KASPMaster Mix 2.5μL,Primer mix0.075μL,共5.075μL。
5.根据权利要求4所述的用于检测西瓜橙/黄瓤色性状的KASP标记引物组合的应用,其特征在于:
所述Primer mix:将上游引物1、上游引物2、下游引物分别用ddH2O稀释到50μM后,再将上游引物1、上游引物2、下游引物按照1:1:3的摩尔浓度比例混合。
6.根据权利要求3所述的用于检测西瓜橙/黄瓤色性状的KASP标记引物组合的应用,其特征在于:所述PCR扩增反应的反应程序为:95℃预变性10min;95℃15s,61℃45s,共10个循环,每个循环降0.6℃;95℃15s,55℃1min,共34个循环。
7.用于检测西瓜橙/黄瓤色性状的KASP标记引物组合的应用,其特征在于:所述应用:培育具有西瓜橙/黄瓤色性状的新植株。
8.根据权利要求书7所述的用于检测西瓜橙/黄瓤色性状的KASP标记引物组合的应用,其特征在于:包括以下步骤:
步骤1、以受体亲本P1,与供体亲本P2配制F1代杂交组合;再以受体亲本P1作为轮回亲本进行回交,获得BC1F1代回交分离群体;
步骤2、对所述BC1F1代回交分离群体,采用KASP标记引物组合进行基因型检测,选取基因型为GG的单株继续回交,获得BC2F1代回交分离群体;
步骤3、对所述BC2F1代回交分离群体,采用KASP标记引物组合进行基因型检测,选取基因型为GG的单株,继续回交n代,获得BCnF1代回交分离群体;所述n为3-8的整数;
步骤4、对BCnF1代回交分离群体,采用KASP标记引物组合进行基因型检测,选取基因型为GG的单株自交。
9.根据权利要求书8所述的用于检测西瓜橙/黄瓤色性状的KASP标记引物组合的应用,其特征在于:所述步骤3中,n为4。
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