[发明专利]一种亲子鉴定的方法

说明书

本发明公开了一种亲子鉴定的方法，属于亲子鉴定技术领域。S101：对孕妇两次妊娠的游离DNA样本的二态性位点进行测序分别得到DNA数据S1和S2；S102：分别获取S1和S2中含有胎儿信号的分型位点集X(S1)和X(S2)；S103：根据S1和S2分别计算得到胎儿的DNA浓度p1和p2；S104：根据公式Ⅱ计算共有率K，K=[X(S1)∩X(S2)]/[X(S1)∪X(S2)] (Ⅱ)；S105：根据K、p1和p2的聚类模型判断两次妊娠的胎儿的亲缘关系。无需疑父样本，可通过比较两次独立妊娠之间的DNA数据来判断胎儿是否为同一个父亲。

技术领域

本发明属于亲子鉴定技术领域，特别涉及一种亲子鉴定的方法。

背景技术

DNA亲子鉴定就是利用法医学、生物学和遗传学的理论和技术，从子代和亲代的形态构造或生理机能方面的相似特点，分析遗传特征，判断父母与子女之间是否是亲生关系。常见的亲子鉴定为父子关系的亲子关系。父子关系的亲子关系，通常需要疑父样本和孩子或胎儿的样本，但是由于外出务工或者隐私问题等，不方便直接获取疑父样本。

发明内容

孕妇外周血游离DNA是孕妇DNA和胎儿DNA的混合信号，通过计算可以判别出同一个孕妇两次独立妊娠之间共有的胎儿信号位点数所占总共的胎儿信号位点数的比例P(即K)。当孕妇两次独立妊娠的胎儿是来源于同一个父亲（即胎儿之间为同母同父）关系时，该比例P可以聚集并拟合一个模型M(PT)；当孕妇两次独立妊娠的胎儿不是来源于同一个父亲（即胎儿之间为同母异父）关系时，P可以聚集并拟合另一个模型M(NPT)。当两个模型之间有显著差异时，可以用这种差异来对两次独立妊娠之间胎儿的关系进行识别和鉴定。如果待测样本S1和S2获得的P可以明显和两次独立妊娠的胎儿为同一个父亲（即胎儿之间为同父同母）的P值聚类在一起时，我们认为待测样本S1和S2对应的孕妇胎儿之间为同父同母的关系，即胎儿的父亲为同一个人，反之，两次独立妊娠之间的胎儿为同母异父的关系，胎儿的父亲不是同一个人。因此，本发明实施例提供了一种亲子鉴定的方法，该方法包括以下步骤：

S101：对孕妇两次妊娠的游离DNA样本的二态性位点进行测序分别得到DNA数据S1和S2；

S102：分别获取S1和S2中含有胎儿信号的分型位点集X(S1)和X(S2)；

S103：根据S1和S2分别计算得到胎儿的DNA浓度p1和p2；

S104：根据公式Ⅱ计算共有率K，

K=[X(S1)∩X(S2)]/[X(S1)∪X(S2)](Ⅱ)；

S105：根据K、p1和p2与模拟样本的聚类模型的对应关系判断两次妊娠的胎儿为同母同父或同母异父关系，所述聚类模型由孕妇两次妊娠的胎儿关系和胎儿浓度明确的模拟样本按步骤S102和S104聚类胎儿浓度和K得到。

其中，步骤S105具体包括：获取同母同父关系下胎儿浓度与K的聚类模型M(PT)和同母异父关系下胎儿浓度与K的聚类模型M(NPT)，判断K、p1和p2是否符合模型M(PT)或M(NPT)；若K、p1和p2符合模型M(PT)，则判断两个胎儿为同母同父关系；若K、p1和p2符合模型M(NPT)，则判断两个胎儿为同母异父关系；模拟不同胎儿浓度的一次妊娠游离DNA模拟样本，模拟不同胎儿浓度的二次妊娠游离DNA模拟样本；一次妊娠游离DNA模拟样本与二次妊娠游离DNA模拟样本之间部分样本符合同母同父关系，剩余部分样本符合同母异父关系；聚类符合同母同父关系下不同胎儿浓度与对应K值得到聚类模型M(PT)，聚类符合同母异父关系下不同胎儿浓度与对应K值得到聚类模型M(NPT)；p为0-25%。

具体地，M(NPT)和M(PT)通过以下方法得到：

S201：通过中国人群频率随机生成父本DNA样本F1、母本DNA样本M和无关男性DNA样本F2；通过孟德尔遗传定律，由F1和M生成子代Z1和Z2，由F2和M生成子代Z3；