[发明专利]TOMM6突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途

说明书

本发明涉及TOMM6突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途，所述突变TOMM6基因与人类基因组参考序列GRCh37相比具有以下突变中的至少一种：6号染色体物理位置为41755531的碱基由C突变为G、6号染色体物理位置为41755565的碱基由T突变为C；所述突变TOMM6基因的cDNA序列与SEQ ID NO.1的序列相比具有如下突变中的至少一种：c.96CG、c.128+2TC；本发明提供的TOMM6突变基因、检测其的试剂等，挖掘出一种LIMD致病基因TOMM6，并提供了TOMM6突变基因位点，这为LIMD的早期分子筛查、家族遗传研究等提供了重要的依据。

技术领域

本发明涉及疾病相关突变基因，具体涉及一种TOMM6突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途。

背景技术

线粒体存在于绝大部分细胞中，是细胞能量生产的核心细胞器。线粒体功能受损可导致线粒体疾病。根据线粒体功能受损的程度、细胞类型和数量，线粒体疾病患者可出现各种各样的症状，受累器官主要包括心脏、肌肉、眼、耳和大脑等。

线粒体疾病的特别之处是，细胞核中的核基因组DNA(nDNA)的基因突变，以及细胞质中的线粒体基因组DNA(mtDNA)的基因突变均可导致线粒体疾病。mtDNA基因突变导致的线粒体疾病，通常发病较晚；nDNA基因突变导致的线粒体疾病，通常发病较早。在儿童期诊断的线粒体疾病中，由nDNA基因突变导致的占比为75％。与成人线粒体疾病的较高诊断率不同，儿童期线粒体疾病由于症状特异性不高，诊断率显著下降。其中，婴儿致死性线粒体疾病(Lethal Infantile Mitochondrial Disease,LIMD)可导致新生儿期及婴儿期的极高死亡率。重症LIMD患儿发病骤及，甚至在出生后数日或数周内夭折，因而临床和基因诊断率更低。在国外报道LIMD病例中，很多是在尸检中才发现了线粒体疾病的蛛丝马迹。因此，国内外研究指出LIMD的发病率可能被严重低估。现阶段，虽然动物模型等基础研究中已发现千余种基因在线粒体的功能、稳定性、结构维持等方面发挥作用，但已报道的与LIMD相关的致病基因和致病变异却很少。

如能够被及时临床诊断，特别是精准基因诊断，LIMD患儿可通过调控能量代谢，有效降低死亡率，改善远期预后。此外，由于LIMD的基因诊断率低，部分患儿父母无法通过辅助生殖技术或产前诊断技术，阻断继续生育LIMD患儿，导致家庭悲剧再次出现。因此，发现新的LIMD致病基因，并建立快速、准确的新型检测试剂盒，对于提高LIMD的诊疗水平具有重要意义。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与婴儿致死性线粒体疾病有关的TOMM6突变基因、检测其的引物、试剂盒和方法以及其用途。

本发明的目的通过如下技术方案实现：

一种突变TOMM6基因，所述突变TOMM6基因与人类基因组参考序列GRCh37相比具有以下突变中的至少一种：

6号染色体物理位置为41755531的碱基由C突变为G、6号染色体物理位置为41755565的碱基由T突变为C；

所述突变TOMM6基因的cDNA序列与SEQ ID NO.1的序列相比具有如下突变中的至少一种：

c.96CG、c.128+2TC；

所述突变TOMM6基因对应的突变TOMM6蛋白的序列与SEQ ID NO.2的序列相比具有以下突变中的至少一种：

p.Tyr32Ter(第32位酪氨酸突变为终止密码子)、p.Asn44Ter(第44位天冬酰胺突变为终止密码子)。

其中，所述SEQ ID NO.1与SEQ ID NO.2分别如下：

SEQ ID NO.1：