[发明专利]一种基于SCoT分子标记的郑艾2号假杂种鉴定方法在审
申请号: | 202211430286.8 | 申请日: | 2022-11-15 |
公开(公告)号: | CN116334274A | 公开(公告)日: | 2023-06-27 |
发明(设计)人: | 梁慧珍;许兰杰;余永亮;安素妨;谭政委;杨红旗;杨青;李春明;董薇;李磊;鲁丹丹 | 申请(专利权)人: | 河南省农业科学院芝麻研究中心 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 郑州联科专利事务所(普通合伙) 41104 | 代理人: | 张晓萍 |
地址: | 450000 河*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 scot 分子 标记 杂种 鉴定 方法 | ||
1.一种基于SCoT分子标记的郑艾2号假杂种鉴定方法,其特征在于,该方法包括如下步骤:
(1)提取待鉴定样品基因组
参考现有技术,常规提取待检艾草样品的DNA基因组,备用;
同时,以郑艾2号叶片样品的DNA基因组为对照;
(2)PCR扩增
采用如SEQ ID No.1~7的任一引物序列进行PCR扩增;具体引物序列如下:
SCoT7:5’-CAACAATGGCTACCACGG-3’;
SCoT8:5’-CAACAATGGCTACCACGT-3’;
SCoT10:5’-CAACAATGGCTACCAGCC-3’;
SCoT25:5’-ACCATGGCTACCACCGGG-3’;
SCoT26:5’-ACCATGGCTACCACCGTC-3’;
SCoT27:5’-ACCATGGCTACCACCGTG-3’;
SCoT76:5’-CCATGGCTACCACTACCG-3’;
(3)鉴定
首先,依据表型差异,对待检艾草与郑艾2号表型进行对比,从而对待检艾草是否属于“假杂种”进行初步判定;
随后,依据待检艾草样品PCR扩增结果与郑艾2号扩增结果进行比对判定,如果条带结果不一致,则判定待检艾草样品为“假杂种”;如果条带结果一致,则判定待检艾草为郑艾2号。
2.如权利要求1所述基于SCoT分子标记的郑艾2号假杂种鉴定方法,其特征在于,步骤(2)中,PCR扩增时,15μL反应体系设计如下:
引物,1.0μL;
2x Tag Master Mix,9μL;
DNA模板,3μL、50ng/µl;
其余部分用ddH2O补充至15μL;
PCR反应程序:94℃预变性5min;94℃变性90s,50℃退火60s,72℃延伸温度90s,35个循环;72℃延伸温度8min。
3.如权利要求2所述基于SCoT分子标记的郑艾2号假杂种鉴定方法,其特征在于,扩增结束后,对反应产物进行1.2%琼脂糖凝胶电泳检测。
4.郑艾2号鉴定用SCoT分子标记,其特征在于,所述分子标记为SEQ ID No.1~7的引物序列,具体如下:
SCoT7:5’-CAACAATGGCTACCACGG-3’;
SCoT8:5’-CAACAATGGCTACCACGT-3’;
SCoT10:5’-CAACAATGGCTACCAGCC-3’;
SCoT25:5’-ACCATGGCTACCACCGGG-3’;
SCoT26:5’-ACCATGGCTACCACCGTC-3’;
SCoT27:5’-ACCATGGCTACCACCGTG-3’;
SCoT76:5’-CCATGGCTACCACTACCG-3’。
5.权利要求4所述SCoT分子标记在郑艾2号鉴定中的应用。
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