[发明专利]一种基于SCoT分子标记的郑艾2号假杂种鉴定方法

说明书

本申请属于种子品种鉴定技术领域，具体涉及一种基于SCoT分子标记的郑艾2号鉴定方法。该方法包括：提取待鉴定样品基因组、PCR扩增、依据电泳结果鉴定等步骤。本申请中，针对郑艾2号的鉴定需要，结合SCoT‑PCR技术，发明人通过对SCoT引物进行了多态性筛选和对相关反应体系优化和设计，提供了一种较为准确和快速的郑艾2号品种鉴定方法，对于郑艾2号的推广种植和艾草产业的持续发展，具有较好的技术意义。

技术领域

本申请属于种子品种鉴定技术领域，具体涉及一种基于SCoT分子标记的郑艾2号假杂种鉴定方法。

背景技术

艾（ Artemisiaargyi Level.et.Vant）属于菊科（compositae）蒿属（Artemisia）一种多年生草本植物，也是一种集药品、食品、保健品于一体的大宗中药材。现代研究表明，艾叶含有丰富的矿物质元素、黄酮类、挥发油类成分等，具有温经活络、抗菌、抗癌、抗炎、免疫调节、抗凝血等作用。因此，随着中医药健康服务业的快速发展，艾产业的市场需求与日俱增。为此，艾草新品种培育对于艾产业的快速发展具有重要的技术意义。

 “郑艾2号”，是由河南省农业科学院芝麻研究中心采用系统选育法通过从南阳农家种的变异株出发，以高产、稳产、优质、抗病、广适为主攻方向，经过多年选育、筛选培育，并于2022年鉴定通过的艾草新品种（鉴定编号：2021014）。相关分析检测结果表明，其酸不溶性灰分、桉精油、龙脑分别为1.74%、0.960%、0.066%，均符合2020年版《中华人民共和国药典》限量标准。而由于其具有优质、高产稳产、抗逆性强、适应性广，栽培管理简单等特点，因此作为郑艾2号一种中药材种植新品种，具有较好的推广应用前景。

物种（品种）鉴定中，基于不同物种（品种）基因组序列差异是一种较为快速和准确的鉴定方法。其中，目标起始密码子多态性（start codon targeted poly-morphism，SCoT）是一种基于植物基因中ATG起始密码子两侧的短保守区而开发的一种新的标记系统，该技术具有扩增效率高、检测多态性丰富、重复性好、引物通用性强、能获得丰富的遗传信息、识别出不同基因型间的微小差异、准确判断亲缘关系等优点，且PCR反应完成后用琼脂糖凝胶电泳即可检测，操作简单、成本低。因此，在部分物种（品种）鉴定中得到了较好推广。但基于该技术原理可以看出，其主要基于起始密码子部分基因序列差异进行鉴定，因此，该方法能否适用于艾草相关品种鉴定，尤其是能否将拟推广种植的郑艾2号与其他艾草品种进行区分，则仍是需要进一步探索和实验后才能确定的。

发明内容

基于对郑艾2号品种鉴定的技术需要，本申请目的在于提供一组SCoT分子标记，并提供一种基于SCoT分子标记的郑艾2号鉴定方法，从而为郑艾2号的推广和艾草产业的发展奠定一定技术基础。

本申请所采取的技术方案详述如下。

一种基于SCoT分子标记的郑艾2号假杂种鉴定方法，包括如下步骤：

（1）提取待鉴定样品基因组

参考现有技术，常规提取待检艾草样品的DNA基因组，备用；

同时，以郑艾2号叶片样品的DNA基因组为对照；

（2）PCR扩增

采用下述任一引物序列进行PCR扩增，

SCoT7：5’-CAACAATGGCTACCACGG-3’；

SCoT8：5’-CAACAATGGCTACCACGT-3’；

SCoT10：5’-CAACAATGGCTACCAGCC-3’；

SCoT25：5’-ACCATGGCTACCACCGGG-3’；

SCoT26：5’-ACCATGGCTACCACCGTC-3’；

SCoT27：5’-ACCATGGCTACCACCGTG-3’；