[发明专利]一种提高引导编辑系统碱基编辑效率的方法在审
申请号: | 202211488466.1 | 申请日: | 2022-11-25 |
公开(公告)号: | CN116042573A | 公开(公告)日: | 2023-05-02 |
发明(设计)人: | 杨进孝;徐雯;赵久然;杨永星;张璐 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12N9/22 | 分类号: | C12N9/22;C12N9/12;C12N15/113;C12N15/82;C12N5/10;A01H5/00;A01H6/46 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 李洋 |
地址: | 100097 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 提高 引导 编辑 系统 碱基 效率 方法 | ||
1.成套系统,所述成套系统包括融合蛋白、esgRNA和pegRNA;
所述融合蛋白依次包括反转录酶、Cas9切刻酶、自切割寡肽和筛选标记蛋白;
所述esgRNA靶向MLH1基因靶点序列;
所述pegRNA依次包括esgRNA’、逆转录模板序列、引物结合位点序列、连接序列和tevopreQ1基序;所述esgRNA’靶向目标基因靶点序列。
2.根据权利要求1所述的成套系统,其特征在于:
所述esgRNA由MLH1基因靶点序列和esgRNA骨架组成;
或,所述esgRNA’由目标基因靶点序列和esgRNA骨架组成;
或,所述pegRNA由复合型启动子驱动表达;所述复合启动子依次由E35S启动子、CmYLCV启动子和OsU3启动子组成;
或,所述E35S启动子的核苷酸序列如序列7第10025-10461位所示;
或,所述CmYLCV启动子的核苷酸序列如序列7第10462-10920位所示;
或,所述OsU3启动子的核苷酸序列如序列7第10932-11270位所示。
3.根据权利要求1或2所述的成套系统,其特征在于:所述Cas9切刻酶为Cas9maxn;
或,所述Cas9maxn为A1)或A2):
A1)氨基酸序列是序列5所示的蛋白质;
A2)将序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白质。
4.根据权利要求1-3任一所述的成套系统,其特征在于:所述反转录酶为M-MLV RT;
或,所述M-MLV RT为B1)或B2):
B1)氨基酸序列是序列1所示的蛋白质;
B2)将序列1所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白质。
5.根据权利要求1-4任一所述的成套系统,其特征在于:所述自切割寡肽为来源于病毒基因组的2A自切割寡肽;
或,所述来源于病毒基因组的2A自切割寡肽为来源于猪捷申病毒-1的2A自切割寡肽;
或,所述来源于猪捷申病毒-1的2A自切割寡肽的氨基酸序列为C1)或C2):
C1)氨基酸序列是序列3所示的蛋白质;
C2)将序列3所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白质。
6.根据权利要求1-5任一所述的成套系统,其特征在于:所述筛选剂抗性蛋白为潮霉素磷酸转移酶;
或,所述潮霉素磷酸转移酶为D1)或D2):
D1)氨基酸序列是序列4所示的蛋白质;
D2)将序列4所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且具有相同功能的蛋白质。
7.权利要求1-6任一所述的成套系统在如下S1)-S4)任一种中的应用:
S1)生物体或生物细胞基因组序列的编辑;
S2)制备生物体或生物细胞基因组序列的编辑的产品;
S3)提高生物体或生物细胞基因组序列的编辑效率;
S4)制备提高生物体或生物细胞基因组序列的编辑效率的产品。
8.T1)-T3)任一所述的方法:
T1)基因组序列的编辑方法,包括如下步骤:使生物体或生物细胞表达权利要求1中所述的融合蛋白、权利要求1中所述的esgRNA和权利要求1中所述的pegRNA;
T2)提高生物体或生物细胞基因组序列的编辑效率的方法,包括如下步骤:使生物体或生物细胞表达权利要求1中所述的融合蛋白、权利要求1中所述的esgRNA和权利要求1中所述的pegRNA;
T3)生物突变体的制备方法,包括如下步骤:按照T1)或T2)所述的方法对生物体或生物细胞的基因组序列进行编辑,获得生物突变体。
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