[发明专利]一种鉴定圆果杜英的DNA条形码、鉴定方法与应用在审
申请号: | 202211605028.9 | 申请日: | 2022-12-14 |
公开(公告)号: | CN116287372A | 公开(公告)日: | 2023-06-23 |
发明(设计)人: | 谢宜飞;王一麾 | 申请(专利权)人: | 赣南师范大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/29;C12N15/11 |
代理公司: | 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 11385 | 代理人: | 戴嵩玮 |
地址: | 341000 江西省*** | 国省代码: | 江西;36 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 圆果杜英 dna 条形码 方法 应用 | ||
1.一种鉴定圆果杜英的DNA条形码,其特征在于,所述DNA条形码包括ycf1、trnS-atpA和ITS基因序列中的一种或多种;所述ycf1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,所述trnS-atpA的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示,所述ITS的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示。
2.一种鉴定圆果杜英的引物组,其特征在于,所述引物组包括ycf1引物、trnS-atpA引物和ITS引物中的一种或多种;所述ycf1的引物序列如SEQ ID No.4和SEQ ID No.5所示,所述trnS-atpA的引物序列如SEQ ID No.6和SEQ ID No.7所示,所述ITS的引物序列如SEQ IDNo.8和SEQ ID No.9所示。
3.一种鉴定圆果杜英的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求2所述的引物组。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR扩增反应体系,所述PCR扩增反应体系包括DNA模板2μL,10×DreamTaqGreenbuffer5μL,dNTPMix5μL,DMSO2μL,BSA0.5μL,正向引物2μL,反向引物2μL,DreamTaq DNAPloymrerase1.5μL,双蒸水加至50μL。
5.权利要求1所述的DNA条形码、权利要求2所述的引物组或权利要求3或4所述的试剂盒在鉴定圆果杜英中的应用。
6.一种圆果杜英的鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:
提取样品的总DNA,以总DNA为模板,PCR扩增ycf1、trnS-atpA、ITS基因片段,然后对ycf1、trnS-atpA、ITS基因片段测序结果进行拼接,获得联合基因片段,构建样品的联合基因片段BI树,根据BI树判断该样品是否为圆果杜英。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,如果待测样品联合基因片段单独分类出一个大分支,则该样品为圆果杜英。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增反应体系包括DNA模板2μL,10×DreamTaqGreenbuffer5μL,dNTPMix5μL,DMSO2μL,BSA0.5μL,正向引物2μL,反向引物2μL,DreamTaqDNAPloymrerase1.5μL,双蒸水加至50μL;所述PCR扩增程序为:95℃预变性3分钟;95℃变性30秒,52℃退火30秒,72℃扩增1分钟,共30个循环;72℃终扩增10分钟。
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