[发明专利]一种基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法在审

专利信息
申请号: 202211648335.5 申请日: 2022-12-21
公开(公告)号: CN115927540A 公开(公告)日: 2023-04-07
发明(设计)人: 苟德明;王俊 申请(专利权)人: 深圳大学
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12N15/11
代理公司: 深圳市君胜知识产权代理事务所(普通合伙) 44268 代理人: 陈俊贤;殷璐丝
地址: 518060 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 夹板 连接 rna 通量 序文 构建 方法
【权利要求书】:

1.一种基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,包括步骤:

提供S6引物和S7引物,通过所述S6引物和S7引物退火形成夹板接头;

将待测的小RNA进行逆转录,获得一链cDNA;

将所述一链cDNA进行变性;

将变性后的一链cDNA与所述夹板接头混合于连接体系中进行反应,得到连接产物;

利用USER酶对所述连接产物进行消化,得到特定接头序列cDNA;

将所述特定接头序列cDNA与S4引物以及S19引物混合于扩增体系中进行反应,得到所述的小RNA高通量测序文库。

2.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述夹板接头具有双链DNA结构且末端突出6个兼并碱基。

3.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述S6引物的序列为:

CACCTCTCTAUACACUCTTUCCCUACACGACGCTCTUCCGATCUNNN NNN-invT;

所述S7引物的序列为:

Phos-AGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGTATAGAGAGGT G-invT。

4.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,利用基于polyA加尾的小RNA逆转录体系对待测的小RNA进行逆转录。

5.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,利用基于DNA-DNA连接的方式对待测的小RNA的逆转录一链cDNA连接接头,之后利用特异引物进行扩增得到测序文库。

6.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述连接体系包括DNA连接酶以及DNA连接酶缓冲液。

7.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述扩增体系包括DNA聚合酶、dNTP以及缓冲液。

8.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述S4引物的序列如SEQ.ID.NO 1所示;所述S19引物的序列如SEQ.ID.NO 2所示。

9.一种基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法的应用,其特征在于,将如权利要求1-8任一所述的构建方法应用于小RNA测序文库的构建或者qRT-PCR的检测。

10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,所述小RNA包括microRNA、piRNA、siRNA、tRNA以及rRNA。

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