[发明专利]一种基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法在审
申请号: | 202211648335.5 | 申请日: | 2022-12-21 |
公开(公告)号: | CN115927540A | 公开(公告)日: | 2023-04-07 |
发明(设计)人: | 苟德明;王俊 | 申请(专利权)人: | 深圳大学 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳市君胜知识产权代理事务所(普通合伙) 44268 | 代理人: | 陈俊贤;殷璐丝 |
地址: | 518060 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 夹板 连接 rna 通量 序文 构建 方法 | ||
1.一种基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,包括步骤:
提供S6引物和S7引物,通过所述S6引物和S7引物退火形成夹板接头;
将待测的小RNA进行逆转录,获得一链cDNA;
将所述一链cDNA进行变性;
将变性后的一链cDNA与所述夹板接头混合于连接体系中进行反应,得到连接产物;
利用USER酶对所述连接产物进行消化,得到特定接头序列cDNA;
将所述特定接头序列cDNA与S4引物以及S19引物混合于扩增体系中进行反应,得到所述的小RNA高通量测序文库。
2.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述夹板接头具有双链DNA结构且末端突出6个兼并碱基。
3.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述S6引物的序列为:
CACCTCTCTAUACACUCTTUCCCUACACGACGCTCTUCCGATCUNNN NNN-invT;
所述S7引物的序列为:
Phos-AGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGTATAGAGAGGT G-invT。
4.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,利用基于polyA加尾的小RNA逆转录体系对待测的小RNA进行逆转录。
5.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,利用基于DNA-DNA连接的方式对待测的小RNA的逆转录一链cDNA连接接头,之后利用特异引物进行扩增得到测序文库。
6.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述连接体系包括DNA连接酶以及DNA连接酶缓冲液。
7.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述扩增体系包括DNA聚合酶、dNTP以及缓冲液。
8.根据权利要求1所述的基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法,其特征在于,所述S4引物的序列如SEQ.ID.NO 1所示;所述S19引物的序列如SEQ.ID.NO 2所示。
9.一种基于夹板连接的小RNA高通量测序文库的构建方法的应用,其特征在于,将如权利要求1-8任一所述的构建方法应用于小RNA测序文库的构建或者qRT-PCR的检测。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,所述小RNA包括microRNA、piRNA、siRNA、tRNA以及rRNA。
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