[发明专利]一种蛋白质组学标准品及其制备系统在审

专利信息
申请号: 202211676756.9 申请日: 2022-12-26
公开(公告)号: CN116042754A 公开(公告)日: 2023-05-02
发明(设计)人: 杨善;莫俊杰;周鸿凯 申请(专利权)人: 广东海洋大学
主分类号: C12P21/00 分类号: C12P21/00;C12P21/06;C12M1/40;C12M3/00;C12M1/00
代理公司: 北京国坤专利代理事务所(普通合伙) 11491 代理人: 赵红霞
地址: 524088 *** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 蛋白质 标准 及其 制备 系统
【权利要求书】:

1.一种蛋白质组学标准品,其特征在于:所述蛋白质组学标准品为从AC16细胞株中提取获得的细胞全蛋白质或由AC16细胞全蛋白质水解得到的多肽。

2.一种蛋白质组学标准品制备系统,包括细胞存放模块(1),其特征在于:所述细胞存放模块(1)连接有细胞培养模块(2),所述细胞培养模块(2)连接有蛋白质分离模块(3),所述蛋白质分离模块(3)连接有蛋白质水解模块(4);

所述蛋白质分离模块(3)和蛋白质水解模块(4)连接有成品评估模块(5),所述成品评估模块(5)连接有成品保存模块(6)。

3.根据权利要求2所述的一种蛋白质组学标准品制备系统,其特征在于:所述细胞存放模块(1)和成品保存模块(6)连接有冷库模块(7),所述细胞培养模块(2)连接有恒温箱模块(8)和培养器模块(9)。

4.根据权利要求2所述的一种蛋白质组学标准品制备系统,其特征在于:所述蛋白质分离模块(3)包括溶液配制模块(301)和细胞处理模块(304),所述溶液配制模块(301)连接有细胞缓冲液配制(302)和细胞分解液配制(303),所述细胞处理模块(304)连接有破碎处理模块(305)和离心处理模块(307),所述破碎处理模块(305)连接有细胞刮(306),所述离心处理模块(307)连接有离心机(308)。

5.根据权利要求2所述的一种蛋白质组学标准品制备系统,其特征在于:所述蛋白质水解模块(4)连接有试剂处理模块(10)和成品富集模块(11),所述成品评估模块(5)连接有质谱鉴定模块(12)和稳定性评估模块(13)。

6.一种蛋白质组学标准品,其特征在于,所述的蛋白质组学标准品由以下方法制备而成:

S1.AC16细胞预处理

取培养瓶装的AC16细胞,去除外包装,用75%酒精喷洒整个瓶消毒后放到超净台内,静置2-4小时,镜下观察,未超过80%汇合度时,加入5mL培养基混合均匀;

S2.AC16细胞培养

将混合均匀的细胞在1000RPM条件下离心5分钟,弃去上清液,补加4-6mL完全培养基后吹匀,然后将所有细胞悬液加入培养瓶中培养过夜,第二天换液并检查细胞密度,细胞密度达80%-90%,进行传代培养,连续采集9-11个代次细胞,每次分别采集9×106细胞数备用;

S3.总蛋白质获取

冰上操作,配制细胞裂解液和细胞缓冲液,将培养好的细胞进行收集,吸取培养基,预冷细胞缓冲液清洗细胞三次,通过细胞刮(306)将细胞刮脱,收集至离心管,1000rpm离心5分钟,离心后,向细胞沉淀中加入细胞裂解液200μl,混匀后冰上放置40min,10000rpm,4℃,离心15min,上清即为细胞总蛋白质提取物;

S4.总蛋白质水解

向每管200μg的总蛋白质提取物中加入氨基甲脒,加入50mM的DTT,静置30min后加入100mM碘乙酰胺,再次静置30min,去除试剂和交换缓冲液,在适当的pH为7和温度为37℃的环境下,用胰蛋白酶将提取物在碳酸氢铵缓冲液中过夜变性18小时,加入50μL的50mM稀盐酸终止酶切,4℃下12000rpm离心20min收集肽段获得多肽形态的蛋白质组学标准品。

7.根据权利要求6所述的一种蛋白质组学标准品,其特征在于:所述S3中,细胞裂解液组成成分为每1mlNaF溶液加入10μl磷酸酶抑制剂、1μl蛋白酶抑制剂和5μl的100mM的PMSF。

8.根据权利要求6所述的一种蛋白质组学标准品,其特征在于:所述S3中,细胞缓冲液组成成分为每1ml的PBS加入0.2μl的Aprotinin和0.2μl的Leupetin。

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