[发明专利]一种利用SNaPshot技术检测猫血型的方法在审
申请号: | 202211679603.X | 申请日: | 2022-12-26 |
公开(公告)号: | CN115717170A | 公开(公告)日: | 2023-02-28 |
发明(设计)人: | 陈拼;李尚桐;郎丹丹 | 申请(专利权)人: | 北京格致博雅生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 河北冀狮专利代理事务所(特殊普通合伙) 13174 | 代理人: | 何园园 |
地址: | 102600 北京市大兴区中关村科技*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 利用 snapshot 技术 检测 血型 方法 | ||
1.一种利用SNaPshot技术检测猫血型的方法,其特征在于:包括以下步骤:
步骤一:根据SNaPshot分型技术,设计4个SNP位点引物,包括扩增引物、延伸引物,并对扩增引物进行blast特异性比对;
步骤二:提取待测猫的口腔拭子基因组DNA;
步骤三:以待测猫的口腔拭子基因组DNA为模板,利用引物组合进行多重SNaPshot分型检测:包括多重PCR扩增;PCR产物纯化;多重延伸反应;延伸产物纯化;
步骤四:毛细管电泳,分析延伸产物,从而对猫血型进行判定。
2.根据权利要求1所述一种利用SNaPshot技术检测猫血型的方法,其特征在于:所述步骤一中扩增名称为CMAH179-F、CMAH179-R、CMAH268-F、CMAH268-R、CMAH364-F、CMAH364-R、CMAH1322-F、CMAH1322-R;延伸引物名称为CMAH179-YS-F、CMAH268-YS-F、CMAH364-YS-F、CMAH1322-YS-F。
3.根据权利要求1所述一种利用SNaPshot技术检测猫血型的方法,其特征在于:所述步骤一中还包括以下步骤,
a:将扩增引物及延伸引物干粉12000rpm,离心2分钟;
b:按照引物合成说明书,用TE将干粉引物稀释至100μM;
c:再分别将扩增引物上下游稀释至10μM的工作液,按照1:1等比例混合多重扩增引物;
d:将延伸引物稀释至10μM的工作液,按照1:1等比例混合多重延伸引物。
4.根据权利要求1所述一种利用SNaPshot技术检测猫血型的方法,其特征在于:所述步骤二中采用天根“高效口腔拭子基因组DNA提取试剂盒”制备DNA。
5.根据权利要求1所述一种利用SNaPshot技术检测猫血型的方法,其特征在于:所述步骤三中多重PCR扩增步骤如下,
a:预先将PCR扩增组分取出置冰上融化,10×buffer、dNTP、多重扩增引物混合液轻微震荡混匀,离心备用,Hstaq酶离心置于冰上备用;
b:配置PCR扩增混合液,每反应分装9μL;
c:加样,在9μL扩增反应体系中加入1μL DNA;
d:扩增,在PCR仪上进行PCR程序扩增,扩增程序如下:
95℃预变性5分钟;95℃变性30秒、65℃~55℃每循环降低1℃退火30秒、72℃延伸30秒,运行10个循环;95℃变性30秒、55℃退火30秒、72℃延伸30秒,运行25个循环;之后72℃延伸10分钟,4℃保存。
6.根据权利要求1所述一种利用SNaPshot技术检测猫血型的方法,其特征在于:所述步骤三中PCR产物纯化步骤如下,
a:取4μL多重PCR产物;
b:加入2U SAP酶和2U Exonuc lease I酶;37℃温浴1小时;
c:75℃灭活20分钟。
7.根据权利要求1所述一种利用SNaPshot技术检测猫血型的方法,其特征在于:所述步骤四中产物毛细管电泳检测步骤如下,
a:取1μL SAP处理完的延伸产物;
b:加入8.8μL HIDI及0.2μL Liz120,95℃变性3分钟;
c:立即冰浴2分钟,用测序仪进行测序。
8.根据权利要求7所述一种利用SNaPshot技术检测猫血型的方法,其特征在于:所述测序完成后用genemapper6.0对分型结果进行判读,根据延伸引物大小设置panel、bin,依据出峰的位置及颜色判断每个位点的分型。
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