[发明专利]一种鉴定棉花矮生自封顶性状的分子标记组合及其应用和方法

权利要求书

1.一种鉴定棉花矮生自封顶性状的分子标记组合，其特征在于，所述SNP分子标记组合为SNPIDNo.1和SNPIDNo.2；所述InDel分子标记组合为InDelIDNo.1和InDelIDNo.2；

所述SNPIDNo.1位于海岛棉D03染色体上第49155705位，碱基为T；

所述SNPIDNo.2位于海岛棉D03染色体上第49242336，碱基为A；

所述InDelIDNo.1位于海岛棉D03染色体上第49014595位，碱基为C；

所述InDelIDNo.2位于海岛棉D03染色体上第49354509位，碱基为A。

2.权利要求1所述的分子标记组合在鉴定花矮生自封顶性状中的应用。

3.权利要求1所述的分子标记组合在棉花矮生自封顶品种的分子辅助育种中的应用。

4.一种权利要求1所述的分子标记组合的引物组合，其特征在于，所述SNPIDNo.1的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示；所述SNPIDNo.2的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示，下游引物的核苷酸序列如SEQID No.4所示；所述InDelID No.1的上游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.6所示；所述InDelID No.2的上游引物的核苷酸序列如SEQ IDNo.7所示，下游引物的核苷酸序列如SEQ ID No.8所示。

5.权利要求4所述的引物组合在鉴定棉花矮生自封顶性状中的应用。

6.权利要求4所述的引物组合在鉴定棉花矮生自封顶品种的分子辅助育种中的应用。

7.一种鉴定棉花矮生自封顶性状的试剂盒，其特征在于，包括权利要求4所述的引物组合。

8.一种鉴定棉花矮生自封顶性状的的方法，其特征在于，包括以下步骤：

1)以待检测棉花DNA为模板，经权利要求4所述的引物组合进行PCR扩增，得到扩增产物；

2)对所述步骤1)得到的扩增产物进行基因分型，当SNPIDNo.1在海岛棉D03染色体上第49155705位的碱基为T和SNPIDNo.2在海岛棉D03染色体上第49242336位的碱基为A时，待检测棉花为棉花矮生自封顶性状；或当InDelIDNo.1位于海岛棉D03染色体上第49014595位的碱基为C和InDelIDNo.2位于海岛棉D03染色体上第49354509位的碱基为A时，待检测棉花为棉花矮生自封顶性状。

9.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述步骤1)PCR扩增的体系每20μl包括：2μl浓度为50～300ng/μL的基因组DNA、特异性扩增引物正反向浓度为10μM引物各为1μl、10×PCRBuffer 2μl、2.5mM dNTP 1.6μl、TaqDNA Polymerase 0.2μl和ddH₂O 12.2μl。

10.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，所述步骤1)PCR扩增的程序包括：94℃3min；94℃30s，60℃30s，72℃30s，32个循环；72℃10min。