[发明专利]一种用于鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的引物、试剂盒及应用在审
申请号: | 202211695111.X | 申请日: | 2022-12-28 |
公开(公告)号: | CN116555433A | 公开(公告)日: | 2023-08-08 |
发明(设计)人: | 朱克诚;张殿昌;刘俊;张楠;郭华阳;刘宝锁;杨静文 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院南海水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 广州知友专利商标代理有限公司 44104 | 代理人: | 宣国华;刘艳丽 |
地址: | 510300 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 鉴别 黄鳍棘鲷 和平 引物 试剂盒 应用 | ||
本发明公开了一种用于鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的引物,所述引物为引物1或引物2,所述引物1包括正向引物1F和反向引物1R,所述正向引物1F的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述反向引物1R的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;所述引物2包括正向引物2F和反向引物2R,所述正向引物2F的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示,所述反向引物2R的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。本发明还公开了一种鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的试剂盒和方法,以及上述引物、试剂盒和方法在鉴别黄鳍棘鲷和平鲷中的应用。
技术领域
本发明属于分子生物学技术领域,具体涉及一种用于鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的引物、试剂盒及应用。
背景技术
鱼类线粒体基因组DNA包括:1个主要的非编码区(D-loop)、1个轻链复制起始区(OL)、2个核糖体RNA基因(12rRNA和16S rRNA)、22个转运RNA基因(tRNA)以及13个蛋白质编码基因。鲷科(Sparidae)隶属于硬骨鱼纲(Osteichthyes)、鲈形目(Perciformes)、鲈亚目(Percoidei)。目前已报道世界有34属133种,广泛分布于大西洋、印度洋和太平洋的温带至热带水域。鲷科鱼类肉质鲜美、营养丰富,经济价值较高,在中国乃至世界海洋渔业资源中占据重要地位。许多种类是名贵经济鱼类和重要的海水养殖对象,如黄鳍棘鲷(Acanthopagrus latus(Houttuyn,1782))、平鲷[Rhabdosargussarba(1775)]等。近年来,随着人工繁育技术的成功,中国鲷科鱼类的养殖面积不断扩大,养殖品种也不断增加。
由于黄鳍棘鲷和平鲷在形态学特征上有很多相似之处,尤其在鱼苗阶段,很难通过肉眼对其进行区分,这给苗种场的鱼苗筛选和管理带来很多不便。目前CN115094145A公开了一种黄鳍棘鲷SNP标记及其筛选方法以及CN109055571A公开了黄鳍棘鲷微卫星标记的特异性引物及应用,但这两个专利主要用于黄鳍棘鲷的家系鉴定、种群遗传结构、遗传育种、亲子鉴定等。此外CN103131762A公开了一种鉴定平鲷的分子生物学方法,但是该引物仅适用于鉴别平鲷,而不适用其他鲷科鱼类的分子鉴定,且该引物设计采用其它鱼类通用引物和平鲷特异性引物相结合的方式。因此,研发一种能够同时快速、有效的鉴别区分两种鲷科鱼类的方法,对于水产养殖中的鲷科鱼类物种鉴定具有重要意义。
发明内容
本发明的目的在于提供一种用于鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的引物及试剂盒。
本发明的目的还在于提供一种鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的方法。
本发明的最后一个目的在于提供上述引物、试剂盒和方法在鉴别黄鳍棘鲷和平鲷中的应用。
本发明的上述第一个目的可以通过以下技术方案来实现:一种用于鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的引物,所述引物为引物1或引物2,所述引物1包括正向引物1F和反向引物1R,所述正向引物1F的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,所述反向引物1R的核苷酸序列如SEQ IDNO:2所示;所述引物2包括正向引物2F和反向引物2R,所述正向引物2F的核苷酸序列如SEQID NO:3所示,所述反向引物2R的核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。
具体的:
引物1的核苷酸序列包含一正向引物1F和一反向引物1R,核苷酸序列分别为:
正向引物1F:TCTATGGTTTGCAGAGTTGC;
反向引物1R:ATTGAATCCTGATGGATGGC。
引物2的核苷酸序列包含一正向引物2F和一反向引物2R,核苷酸序列分别为:
正向引物2F:AACAAGCGAGGACATCACTG;
反向引物2R:GATGTTGCACGTGGCGCTCA。
本发明还提供一种用于鉴别黄鳍棘鲷和平鲷的试剂盒,包括所述的引物。
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