[发明专利]双峰驼产奶性状相关基因EVX2及其作为分子标记的应用

说明书

本发明属于生物技术领域，尤其是涉及双峰驼产奶性状相关基因EVX2及其作为分子标记的应用。本发明利用二代测序技术对162头双峰驼进行基因组重测序，通过与骆驼非脂固体率性状进行全基因组关联分析，鉴定出EVX2基因中与双峰驼驼乳中非脂固体率高/低相关的分子标记。该标记位于5号染色体48754135bp位点，发生CA单碱基突变(g.48754135CA)，该突变位点可以提高驼奶的非脂固体率，利用该标记能针对双峰驼的驼非脂固体率性状开展分子标记辅助选择。

技术领域

本发明属于生物技术领域，尤其是涉及双峰驼产奶性状相关基因EVX2及其作为分子标记的应用。

背景技术

双峰驼乳营养成分多、胰岛素含量高、易消化吸收而深受销费者喜爱，在国内外市场上供不应求。但是我国双峰驼品种原始，未进行过乳用性驼的定向选育，平均产乳水平较低，日产乳量仅1kg/峰左右，而个别驼日产量可达6kg以上，个体间差异极大，选育提高产乳量的空间很大。但有关双峰驼产奶性状相关基因研究报道较少，而利用现代生物分子标记辅助双峰驼育种提高产奶性能的技术尚未见报道。目前乳用性状分子水平上的研究多集中在牛、羊上，而双峰驼乳用性能的研究则主要集中于表型数据的收集与整理及初期泌乳规律和泌乳特性的分析上。因此，亟待进一步从分子遗传水平深入研究双峰驼泌乳机制及调控机理，是加快双峰驼乳用性能提高的主要途径之一。双峰驼是内蒙古特色畜种资源，双峰驼役用的作用已经大大减弱，正在由传统的单一的生产方式向生产专门化、商品化的方向转变。驼产品主要包括：驼乳、驼肉、驼皮、驼骨等。驼乳是其中重要一个组成部分，驼乳因有益于身体健康而深受消费者欢迎，在市场上供不应求的乳品。但与此同时，驼乳的产乳量较低，造成生产效率不高，具有一定的局限性，因此，如何提高产乳量直接关系着驼乳产业的发展，对牧区农牧民增收以及社会稳定具有重要意义。非脂固体是指驼奶中除了脂肪和水以外的物质总称，主要包括蛋白质、碳水化合物、矿物质、维生素等。非脂固体率越高，说明奶中营养物质含量高，奶品质越好。传统的育种方式主要是利用表型信息和系谱信息进行杂交选育，对遗传力低和测量复杂的性状，存在测定成本高、时间长、育种过程复杂的问题。随着高通量测序技术、生物信息学及统计学方法的快速发展，全基因组关联分析(GenomeWide AssociaCion SCudy,GWAS)已成为禽畜重要性状主效基因挖掘与鉴定的主要手段。

发明内容

基于现有技术中缺少从分子遗传水平深入研究双峰驼泌乳机制及调控机理的现状，本发明提供一种双峰驼产奶性状相关基因EVX2及其作为分子标记的应用。

本发明将选择的分子标记应用于筛选出非脂固体率高/低的双峰驼，为选育具有优良性状的双峰驼品种提供技术支撑。

本发明的目的可以通过以下技术方案来实现：

本发明首先提供一种双峰驼产奶性状相关基因EVX2作为与双峰驼产奶性状相关的分子遗传标记的应用。

进一步地，所述产奶性状具体是指双峰驼非脂固体率。

进一步地，提供一种与双峰驼非脂固体率相关的SNP分子标记，位于双峰驼5号染色体48754135处核酸位点，该位点的碱基为C或A，包含在EVX2基因内含子内，其中，EVX2基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。

本发明进一步提供所述SNP分子标记进行选育或辅助选育双峰驼泌乳相关品种或品系的方法，具体是选育或辅助选育非脂固体率高/低的双峰驼。

进一步地，基于所述SNP分子标记选育或辅助选育非脂固体率高/低的双峰驼详细步骤为：采集双峰驼组织样或血液样本，提取双峰驼基因组DNA，检测双峰驼的第5号染色体48754135核苷酸的序列为C或A，确定待测双峰驼的基因型是CC、CA或AA型，根据需要选择AA基因型或者CC基因型的双峰驼进行下一步选种和/或育种。

进一步说明，所述AA基因型双峰驼非脂固体率高于CA型双峰驼，CA基因型双峰驼非脂固体率则高于CC基因型双峰驼。