[发明专利]一种简便的可视化快速核酸检测方法及其应用在审
申请号: | 202211722460.6 | 申请日: | 2022-12-30 |
公开(公告)号: | CN116218960A | 公开(公告)日: | 2023-06-06 |
发明(设计)人: | 蒋玮;吴潇;白蓝;何川;陈一帆;贾军伟 | 申请(专利权)人: | 上海市农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/682 | 分类号: | C12Q1/682;C12Q1/689;C12R1/19 |
代理公司: | 上海开祺知识产权代理有限公司 31114 | 代理人: | 费开逵 |
地址: | 201106 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 简便 可视化 快速 核酸 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种简便的可视化快速核酸检测方法,其特征在于,所述可视化快速核酸检测方法采用以下检测体系,包括:
(1)PMNT,或者与PMNT相似的和单链核酸混合会发生颜色变化的聚合物;
(2)Cas12a蛋白,所述Cas12a蛋白是Cas12a或者具有与Cas12a类似的反式单链DNA切割活性的Cas蛋白;
(3)crRNA,所述crRNA引导Cas12a蛋白特异性与靶标核酸分子结合;
(4)报告分子,所述报告分子是ssDNA分子,可与PMNT结合,使溶液显现红色,当所述报告分子被所述Cas12a蛋白反式切割后,使溶液呈现黄色;
其中,将待测样本加入所述检测体系中,通过溶液在自然光下的颜色变化实现一种可视化快速核酸检测:当报告分子被Cas12a蛋白切割,溶液呈现黄色,表示所述待测样本中存在对应的靶标核酸分子;当报告分子不被Cas12a蛋白切割,溶液呈现红色,则表示所述待测样本中不存在对应的靶标核酸分子。
2.根据权利要求1所述的可视化快速核酸检测方法,其特征在于,所述与PMNT相似的和单链核酸混合会发生颜色变化的聚合物为聚(9,9-二正辛基芴基-2,7-二基)。
3.根据权利要求1所述的可视化快速核酸检测方法,其特征在于,所述ssDNA分子的结构为Nm,其中,N代表选自A、T、C、G的任一碱基;m为14~18的正整数。
4.根据权利要求1所述的可视化快速核酸检测方法,其特征在于,在所述检测体系中,ssDNA分子的浓度为1~10μM。
5.根据权利要求4所述的可视化快速核酸检测方法,其特征在于,在所述检测体系中,ssDNA分子的浓度为2.5~5μM。
6.根据权利要求1所述的可视化快速核酸检测方法,其特征在于,在所述检测体系中,所述PMNT的浓度为25~100μM。
7.根据权利要求6所述的可视化快速核酸检测方法,其特征在于,在所述检测体系中,所述PMNT的浓度为50~100μM。
8.根据权利要求1所述的可视化快速核酸检测方法,其特征在于,采用30μL检测体系,其组成为:1X NEBuffer,30nM crRNA,30nM EnGen Lba Cas12a,1.3U/μL RNaseinhibitor,1~10μM ssDNA-15nt,30nM待测DNA,25~100μMPMNT。
9.一种根据权利要求1~8中任意一项所述的简便的可视化快速核酸检测方法的应用,其特征在于,包括在环境监控、食品安全、医疗、动植物传染病防控领域中的应用。
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