[发明专利]一种体外快速合成环状DNA的方法在审
申请号: | 202310017485.4 | 申请日: | 2023-01-06 |
公开(公告)号: | CN116004610A | 公开(公告)日: | 2023-04-25 |
发明(设计)人: | 贺权源;左珊如;周军华 | 申请(专利权)人: | 湖南师范大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 长沙智路知识产权代理事务所(普通合伙) 43244 | 代理人: | 张毅 |
地址: | 410013 *** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 体外 快速 合成 环状 dna 方法 | ||
1.一种体外快速合成环状DNA的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1.以基因组为模板,针对所需合成环状DNA对应的线性DNA片段分别设计正向引物和反向引物进行PCR,产生线性DNA-A片段;
S2.以步骤S1制得的DNA-A片段为模板,分别设计引物产生1/2A片段,分别为DNA-C片段和DNA-D片段;
S3.将步骤S2制得的1/2A片段进行梯度退火,产生黏性DNA-C片段和DNA-D片段;
S4.用T7连接酶连接步骤S3制得的黏性DNA-C片段和DNA-D片段;
S5.以步骤S4制得的DNA片段为模板,再进行PCR,产生DNA-E片段;
S6.将DNA-A片段和DNA-E片段经过TaqDNALigase试剂进行成环反应,制得环状DNA。
2.根据权利要求1所述体外快速合成环状DNA的方法,其特征在于,设计1/2A片段的引物设计为互补结构。
3.根据权利要求1所述体外快速合成环状DNA的方法,其特征在于,步骤S1中所述PCR体系如下:2*PCR缓冲液forKODFX20-30μL,2mMdNTPs8-12μL,F-Primer1-2μL,R-Primer1-2μL,GenomicDNA180-220ng,KODFX0.5-1.5μL,ddH2O加至50μL。
4.根据权利要求1所述体外快速合成环状DNA的方法,其特征在于,步骤S1中所述PCR反应条件为:90-96℃,2min;95-100℃,10s,50-60℃,30s,65-75℃,3min,30循环;3-5℃,∞。
5.根据权利要求1所述体外快速合成环状DNA的方法,其特征在于,步骤S2和步骤S4的反应体系和反应条件与步骤S1相同。
6.根据权利要求1所述体外快速合成环状DNA的方法,其特征在于,步骤S3的反应体系如下:DNA-C片段20μL,DNA-C’片段20μL,5*DNAAnnealing缓冲液10μL,总计50μL。
7.根据权利要求1所述体外快速合成环状DNA的方法,其特征在于,步骤S3的反应条件如下:90-100℃,3min;85-95℃,3min;80-90℃,3min,以每下降5℃维持3min,梯度降温至25℃。
8.根据权利要求1所述体外快速合成环状DNA的方法,其特征在于,步骤S4的反应体系如下:DNALigaseReaction缓冲液10μL,黏性DNA-C片段5μL,黏性DNA-D片段5μL,DNAliagse1μL,总计21μL;反应条件:25℃,30min-1h,失活:65℃,20min。
9.根据权利要求1所述体外快速合成环状DNA的方法,其特征在于,步骤S6的反应体系如下:DNA-A片段400-600ng,DNA-E片段400-600ng,TaqDNA LigaseReaction缓冲液6-8μL,TaqDNALigase1-3μL,ddH2O补足至50μL。
10.根据权利要求1所述体外快速合成环状DNA的方法,其特征在于,步骤S6的反应条件如下:90-100℃,3min,55-65℃,10min,35-40℃,5min,10循环。
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