[发明专利]基于ARMS检测不同SARS-CoV-2突变株的引物探针组合、试剂盒及应用

权利要求书

1.一种基于突变扩增阻滞系统检测不同SARS-CoV-2突变株的引物探针组合，其特征在于，包括分别用于检测S基因的突变位点的引物和探针，所述突变位点包括△69-70 aa、V126A、△242-244 aa、K417N、K417T、L452R、E484K、E484Q、E484A、N501Y、P681R、P681H和F888L，其中，

用于检测△69-70 aa的引物序列分别如SEQ ID No. 1和SEQ ID No. 3所示，探针序列如SEQ ID No. 2所示；

用于检测V126A的引物序列分别如SEQ ID No. 10和SEQ ID No. 12所示，探针序列如SEQ ID No. 11所示；

用于检测△242-244 aa的引物序列分别如SEQ ID No. 19和SEQ ID No. 21所示，探针序列如SEQ ID No. 20所示；

用于检测K417N的引物序列分别如SEQ ID No. 28和SEQ ID No. 30所示，探针序列如SEQ ID No. 29所示；

用于检测K417T的引物序列分别如SEQ ID No. 37和SEQ ID No. 39所示，探针序列如SEQ ID No. 38所示；

用于检测L452R的引物序列分别如SEQ ID No. 46和SEQ ID No. 48所示，探针序列如SEQ ID No. 47所示；

用于检测E484K的引物序列分别如SEQ ID No. 55和SEQ ID No. 57所示，探针序列如SEQ ID No. 56所示；

用于检测E484Q的引物序列分别如SEQ ID No. 64和SEQ ID No. 66所示，探针序列如SEQ ID No. 65所示；

用于检测E484A的引物序列分别如SEQ ID No. 73和SEQ ID No. 75所示，探针序列如SEQ ID No. 74所示；

用于检测N501Y的引物序列分别如SEQ ID No. 82和SEQ ID No. 84所示，探针序列如SEQ ID No. 83所示；

用于检测P681R的引物序列分别如SEQ ID No. 91和SEQ ID No. 93所示，探针序列如SEQ ID No. 92所示；

用于检测P681H的引物序列分别如SEQ ID No. 100和SEQ ID No. 102所示，探针序列如SEQ ID No. 101所示；

用于检测F888L的引物序列分别如SEQ ID No. 109和SEQ ID No. 111所示，探针序列如SEQ ID No. 110所示，

各探针的5'端利用第一荧光基团标记，3'端利用第一淬灭基团标记。

2.根据权利要求1所述的引物探针组合，其特征在于，还包括用于检测ORF1ab基因的引物和探针，用于检测ORF1ab基因的引物序列分别如SEQ ID No. 118和SEQ ID No. 120所示，探针序列如SEQ ID No. 119所示，5'端利用第一荧光基团标记，3'端利用第一淬灭基团标记。

3.根据权利要求2所述的引物探针组合，其特征在于，还包括用于检测人GAPDH基因的引物和探针，用于检测人GAPDH基因的引物序列分别如SEQ ID No. 121和SEQ ID No. 123所示，探针序列如SEQ ID No. 122所示，5'端利用第二荧光基团标记，3'端利用第二淬灭基团标记，其中，所述第二荧光基团与所述第一荧光基团不同，相应地，所述第二淬灭基团与所述第一淬灭基团不同。

4.根据权利要求3所述的引物探针组合，其特征在于，将各个用于检测SARS-CoV-2 S基因的突变位点的引物和探针，以及用于检测ORF1ab基因的引物和探针，分别与用于检测人GAPDH基因的引物和探针混合在一起，形成14个混合体系。

5.一种基于突变扩增阻滞系统检测不同SARS-CoV-2突变株的试剂盒，其特征在于，包括权利要求1~4任一所述的引物探针组合。